RNA–Protein interactions for RNA: YLR073C

RFU1, Transcript of Protein that inhibits Doa4p deubiquitinating activity, yeast

Gene RFU1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFU1	YLR073C	PMS1	P14242	873 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	MER1	P16523	270 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	HNM1	P19807	563 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	ADK2	P26364	225 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	YEL1	P34225	687 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
RFU1	YLR073C	MYO3	P36006	1272 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	RPC37	P36121	282 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	CCL1	P37366	393 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	SEA4	P38164	1038 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	ARP1	P38696	384 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	RAD55	P38953	406 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	PSY2	P40164	858 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	SLD3	P53135	668 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	LSB1	P53281	241 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	MUK1	Q02866	612 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	GIS1	Q03833	894 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	TAF11	Q04226	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	APL4	Q12028	832 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	ISA2	Q12425	185 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	MSS18	P08593	268 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	MCM1	P11746	286 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	AAC3	P18238	307 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	MRPL33	P20084	86 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	REC107	P21651	314 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	DAL7	P21826	554 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	RPC53	P25441	422 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	DAL80	P26343	269 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	MSS51	P32335	436 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	RIB7	P33312	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	SLC1	P33333	303 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	DID4	P36108	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	BIT2	P38346	545 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	CKB2	P38930	258 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	MEF2	P39677	819 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	KHA1	P40309	873 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	YIR016W	P40572	265 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	CIR1	P42940	261 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	QRI7	P43122	407 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	IRC6	P43615	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	YJR096W	P47137	282 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	RSM26	P47141	266 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	AIM14	P53109	570 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	ADA2	Q02336	434 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	RRD2	Q12461	358 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	SRD1	P09007	221 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	PDX1	P16451	410 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	PEX1	P24004	1043 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	MSH1	P25846	959 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	MKK2	P32491	506 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	ELM1	P32801	640 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	UGA4	P32837	571 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	DOM34	P33309	386 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	MDL1	P33310	695 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	TVP38	P36164	337 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	BUD16	P39988	312 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	PIC2	P40035	300 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	YTA6	P40328	754 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	UBP7	P40453	1071 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	MOB1	P40484	314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	YFL052W	P43551	465 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	GCV2	P49095	1034 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	PCL10	P53124	433 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	CIK1	Q01649	594 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	MLH2	Q07980	695 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	PEX15	Q08215	383 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	REX3	Q12090	404 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	FLP1	P03870	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	SWI5	P08153	709 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	APE1	P14904	514 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	SFL1	P20134	766 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	MSH3	P25336	1018 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	NTG1	P31378	399 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	NPL6	P32832	435 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RFU1	YLR073C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
RFU1	YLR073C	GCS1	P35197	352 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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