RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W SLC1P33333 303 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W JEM1P40358 645 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W SMK1P41808 388 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W BNA2P47125 453 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W NIT3P49954 291 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W RRT6P53117 311 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W ATP25Q03153 612 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W TLG1Q03322 224 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W NSE5Q03718 556 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W SIZ1Q04195 904 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W MDM38Q08179 573 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W FIG2P25653 1609 aa4.52□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W TPM1P17536 199 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W HOP1P20050 605 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W HCM1P25364 564 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W PAH1P32567 862 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W TRM2P33753 639 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W STV1P37296 890 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W APE3P37302 537 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W LRP1P38801 184 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W SIP5P40210 489 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W GYP8P43570 497 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W ASK10P48361 1146 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W PHO23P50947 330 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W MTC3P53077 123 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W AIM14P53109 570 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W VPS62P53285 467 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W SLI1P53304 468 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W ECM9Q02202 377 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W NHX1Q04121 633 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W CRF1Q04930 467 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W YLR224WQ05947 369 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W XYL2Q07993 356 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W PUS9Q12069 462 aa4.51□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W NPP1P25353 742 aa4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W CDC48P25694 835 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W SDS22P36047 338 aa4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W MCD4P36051 919 aa4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W POP2P39008 433 aa4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W SAW1P39735 261 aa4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W VHR1P40522 640 aa4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W RNR4P49723 345 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W MNN10P50108 393 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W SUN4P53616 420 aa4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W FCP1Q03254 732 aa4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W YHM2Q04013 314 aa4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W VTI1Q04338 217 aa4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W YKU80Q04437 629 aa4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W PSR1Q07800 427 aa4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W HMI1Q12039 706 aa4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W SFI1Q12369 946 aa4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W PMD1P32634 1753 aa4.5□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W STF1P01098 86 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W HMG1P12683 1054 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W GFA1P14742 717 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W AAC3P18238 307 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W DAL7P21826 554 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W NPL6P32832 435 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W EMC3P36039 253 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W MUD2P36084 527 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W HSL7P38274 827 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W YIL166CP40445 542 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W IRC6P43615 237 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W BFA1P47113 574 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W MSE1P48525 536 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W OCA1P50946 238 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W VPS9P54787 451 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W MRPL13Q02204 264 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W TAF11Q04226 346 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W CIA1Q05583 330 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W ADY3Q07732 790 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W MET7Q08645 548 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W YPL191CQ08930 360 aa4.49□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W SEM1O94742 89 aa4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W NUC1P08466 329 aa4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W NAT1P12945 854 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W YKL151CP36059 337 aa4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W CCT3P39077 534 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W YEL068CP39977 110 aa4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W TOK1P40310 691 aa4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W MND2P40577 368 aa4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W AXL1P40851 1208 aa4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W CIR1P42940 261 aa4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W UPF3P48412 387 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W SAP4P53036 818 aa4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W SFB2P53953 876 aa4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W RBA50Q04418 439 aa4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W YDR338CQ05497 695 aa4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W YDR286CQ05530 114 aa4.48□□□□□ -1.69
PIR3YKL163W TPO1Q07824 586 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.9 ms