RNA–Protein interactions for RNA: YHR016C

YSC84, Transcript of Actin-binding protein, yeast

Gene YSC84, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YSC84	YHR016C	MIG2	P53035	382 aa		12.08	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	NUT1	P53114	1132 aa		12.08	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	COS6	P53344	381 aa		12.08	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	SNA3	P14359	133 aa		12.07	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	APN2	P38207	520 aa		12.07	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	YHL008C	P38750	627 aa		12.07	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	TAF1	P46677	1066 aa		12.07	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	NMA111	P53920	997 aa		12.07	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	ACL4	Q03771	387 aa		12.07	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	ADY3	Q07732	790 aa		12.07	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	POX1	P13711	748 aa		12.06	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	TSC10	P38342	320 aa		12.06	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	ULI1	P43604	169 aa		12.06	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	ARO80	Q04052	950 aa		12.06	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.06	□□□□□ -0.48	not detected
YSC84	YHR016C	YLL056C	Q12177	298 aa		12.06	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	NUP120	P35729	1037 aa		12.05	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	PEP8	P40335	379 aa		12.05	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	CIR2	Q08822	631 aa		12.05	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	HFI1	Q12060	488 aa		12.05	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	GPA2	P10823	449 aa		12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	SNT1	P25357	1226 aa		12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	SRB2	P34162	210 aa		12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	FLR1	P38124	548 aa		12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	YDR089W	P38966	869 aa		12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	FAR3	P46671	204 aa		12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	MAD3	P47074	515 aa		12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	JJJ3	P47138	172 aa		12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	ALT1	P52893	592 aa		12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	MRM2	P53123	320 aa		12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	RCF2	P53721	224 aa		12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	VPS5	Q92331	675 aa		12.04	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	TSR4	P25040	408 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	VBA3	P25594	458 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	RAD14	P28519	371 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	PRR1	P28708	518 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.03	□□□□□ -0.48	not detected
YSC84	YHR016C	HES1	P35843	434 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	VBA5	P36172	582 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	TRM5	P38793	499 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	YJL206C	P39529	758 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	CHS6	P40955	746 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	POL31	P46957	487 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	PRY3	P47033	881 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	MAS2	P11914	482 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	RIM2	P38127	377 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	FMP33	P46998	180 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	YKU80	Q04437	629 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	VPS54	Q12071	889 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	YPR027C	Q12079	277 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	SUT2	Q12286	268 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	RTP1	Q12751	981 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	IZH4	Q99393	312 aa		12.03	□□□□□ -0.48
YSC84	YHR016C	COX4	P04037	155 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	CHS1	P08004	1131 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	DGR2	P32330	852 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	AST1	P35183	429 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	GPT2	P36148	743 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	TGL4	P36165	910 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YHR054C	P38780	354 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	FRT2	P39734	528 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	MND2	P40577	368 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YJR107W	P47145	328 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YPR003C	P53394	754 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	ULP1	Q02724	621 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	RPM2	Q02773	1202 aa		12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
YSC84	YHR016C	YMR160W	Q03823	816 aa		12.02	□□□□□ -0.49

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