RNA–Protein interactions for RNA: YGL224C

SDT1, Transcript of Pyrimidine nucleotidase, yeast

Gene SDT1, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SDT1	YGL224C	TRM2	P33753	639 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	CTP1	P38152	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	CDS1	P38221	457 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	NPR3	P38742	1146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	VFA1	P40080	203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	IMA5	P40884	581 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	THI6	P41835	540 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	MPS3	P47069	682 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	RFX1	P48743	811 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	PHO23	P50947	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	SSL2	Q00578	843 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	YML131W	Q03102	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	VPS64	Q03944	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	OPY2	Q06810	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	TUP1	P16649	713 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	YCR015C	P25616	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	PHO11	P35842	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	PSY4	P38193	441 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	PHO12	P38693	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	TMN3	P40071	706 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	IRC24	P40580	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	SMK1	P41808	388 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	FHN1	P53279	174 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	NUC1	P08466	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	APL3	P38065	1025 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	EXO84	P38261	753 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	KHA1	P40309	873 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	LRO1	P40345	661 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	ARG2	P40360	574 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	YDL183C	P48569	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	ATG21	Q02887	496 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	VPS34	P22543	875 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	CLB4	P24871	460 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	RER1	P25560	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	YCL049C	P25577	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	FUB1	P25659	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	YHL017W	P38745	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
SDT1	YGL224C	SPC72	P39723	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	PSF2	P40359	213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	CAB2	P40506	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	ATG4	P53867	494 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	GTR1	Q00582	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	TIM44	Q01852	431 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	ENT2	Q05785	613 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	IZH3	Q07959	543 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	DSS4	P32601	143 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	UME6	P39001	836 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	PUG1	P40100	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	IMA1	P53051	589 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	TRS31	Q03337	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	ESC8	Q08119	714 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	TRM13	Q12383	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	MTF2	P10849	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
SDT1	YGL224C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	BET2	P20133	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	RAD16	P31244	790 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	EHT1	P38295	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	VID27	P40157	782 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	AIM21	P40563	679 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	POL31	P46957	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	IDS2	P46958	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	CTR1	P49573	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	SAP4	P53036	818 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	YGR151C	P53287	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	TIM50	Q02776	476 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	ARR3	Q06598	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	USV1	Q12132	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SDT1	YGL224C	BIK1	P11709	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SDT1	YGL224C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SDT1	YGL224C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SDT1	YGL224C	BEM3	P32873	1128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SDT1	YGL224C	LOT5	P34234	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SDT1	YGL224C	PPS1	P38148	807 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SDT1	YGL224C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SDT1	YGL224C	ERR3	P42222	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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