RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W HSL7P38274 827 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YHR131CP38835 850 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W RRN7P40992 514 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W OSW7P43611 510 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data4.27□□□□□ -1.73not detected
SPC105YGL093W MET14Q02196 202 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W MCM16Q12262 181 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W EMP46Q12396 444 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W ARP7Q12406 477 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W PDE1P22434 369 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W MFT1P33441 392 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W TIF5P38431 405 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W CBR1P38626 284 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YHL041WP38730 149 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W NEM1P38757 446 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W FSH1P38777 243 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W AIM18P38884 321 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W END3P39013 349 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W IML2P47031 731 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W ATH1P48016 1211 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W PCL10P53124 433 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W RKM2Q03942 479 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YPQ1Q12010 308 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W ZRT2Q12436 422 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W MPD2Q99316 277 aa4.27□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YIH1P25637 258 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W DAL1P32375 460 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W UFE1P41834 346 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YML6P51998 286 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W NUP84P52891 726 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W INP2Q03824 705 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W TDA9Q04545 1251 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W AIM41Q12032 185 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W NUR1Q12066 484 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W AVL9Q12500 764 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YML002WP0CF17 737 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W REV1P12689 985 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W SLY1P22213 666 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W OLA1P38219 394 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YPR003CP53394 754 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W IMP4P53941 290 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W GCN5Q03330 439 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W AAD15Q08361 143 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YLL056CQ12177 298 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YDR018CQ12185 396 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W HOS1Q12214 470 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa4.26□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W PPH22P23595 377 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W MEI4P29467 408 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W SEC6P32844 805 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W POL12P38121 705 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W EXO1P39875 702 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W RGD2P43556 714 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W DLD2P46681 530 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W BRO1P48582 844 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W RTA1P53047 317 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W KTR6P54070 446 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W LPX1Q12405 387 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W HIS1P00498 297 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W DUG2P38149 878 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W SIF2P38262 535 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W EDC3P39998 551 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YMR134WP40207 237 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W KHA1P40309 873 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W YTP1P53584 459 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W NOG2P53742 486 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W PIR3Q03180 325 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W NSE1Q07913 336 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W RMP1Q12530 201 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W CDC8P00572 216 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W IMA3P0CW40 589 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W IMA4P0CW41 589 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W PEP5P12868 1029 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W KAR3P17119 729 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W FPR1P20081 114 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W BET2P20133 325 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W RPO26P20435 155 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W HEM12P32347 362 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W RPC37P36121 282 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W MRPL40P36534 297 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W POP4P38336 279 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W CRP1P38845 465 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W SMF1P38925 575 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W HEM14P40012 539 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W RAD26P40352 1085 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W BST1P43571 1029 aa4.25□□□□□ -1.73
SPC105YGL093W FLC3P53121 802 aa4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 64.3 ms