RNA–Protein interactions for RNA: YER177W

BMH1, Transcript of 14-3-3 protein, major isoform, yeast

Gene BMH1, Length 804 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BMH1	YER177W	DAL3	P32459	195 aa		5	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	GMH1	P36125	273 aa		5	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	YBR071W	P38243	211 aa		5	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	TDP1	P38319	544 aa		5	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	PAF1	P38351	445 aa		5	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	NIT2	P47016	307 aa		5	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	IOC4	Q04213	475 aa		5	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
BMH1	YER177W	SSM4	P40318	1319 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	TAH11	P47112	604 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	FDC1	Q03034	503 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	HLR1	Q04429	423 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	KCC4	P25389	1037 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	APL3	P38065	1025 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	YHR033W	P38690	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	PRM2	P40534	656 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	IZH3	Q07959	543 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	BNR1	P40450	1375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	MRC1	P25588	1096 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	YIL166C	P40445	542 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	YJR120W	P47157	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	SPC105	P53148	917 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	NMA2	P53204	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	RKI1	Q12189	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	SUT2	Q12286	268 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BMH1	YER177W	ATP12	P22135	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	HXT4	P32467	576 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
BMH1	YER177W	TMN3	P40071	706 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	EMP65	P40085	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	FTR1	P40088	404 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	SLD3	P53135	668 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	DIP5	P53388	608 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	COG6	P53959	839 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	UFO1	Q04511	668 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	AIM41	Q12032	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	SRB8	P25648	1427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	TUP1	P16649	713 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	CDS1	P38221	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	SPC98	P53540	846 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	LAM4	P38800	1345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	RPN13	O13563	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	MTC7	P32633	139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	ELF1	P36053	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	PEA2	P40091	420 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	SNF12	P53628	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	HMG2	P12684	1045 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	EMP70	P32802	667 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	MUP3	P38734	546 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	PPE1	P38796	400 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	YEL020C	P39994	560 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	FOL1	P53848	824 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	KAR1	P11927	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	SPO11	P23179	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	YMC2	P38087	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	YEL076C	P39971	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	THI6	P41835	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	PMT6	P42934	759 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	IRC5	P43610	853 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	PEX14	P53112	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	TIM50	Q02776	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	PEX15	Q08215	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	PPZ2	P33329	710 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	TFC4	P33339	1025 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	MIT1	P40002	666 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BMH1	YER177W	PEF1	P53238	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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