RNA–Protein interactions for RNA: YBL018C

POP8, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP8, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP8	YBL018C	ADH4	P10127	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	VPS33	P20795	691 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	YKL133C	P36066	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	YJL193W	P39542	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	MIT1	P40002	666 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	IMA5	P40884	581 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	MDR1	P53258	950 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	STE4	P18851	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	CDC43	P18898	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	CBP3	P21560	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	PTP2	P29461	750 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	SDS22	P36047	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	TPM2	P40414	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	PMT6	P42934	759 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	HOS1	Q12214	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	NYV1	Q12255	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	ARP7	Q12406	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	PCK1	P10963	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	DMC1	P25453	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	YMC2	P38087	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	SWD1	P39706	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	SPC98	P53540	846 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	TRI1	Q05024	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	SUT2	Q12286	268 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	PHO5	P00635	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	PIF1	P07271	859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	EMP70	P32802	667 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	TDP1	P38319	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	YLF2	P38746	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	GSM1	P42950	618 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	QRI7	P43122	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	STU2	P46675	888 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	YIP4	P53093	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	MFM1	Q02783	413 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	TRS23	Q03784	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	MSS18	P08593	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	SEC12	P11655	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	DSS4	P32601	143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	TAF5	P38129	798 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	HIS6	P40545	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	HOF1	Q05080	669 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	MUP3	P38734	546 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	MAD3	P47074	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	BUD17	P53727	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	USA1	Q03714	838 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	CNE1	P27825	502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	STB5	P38699	743 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	YHL041W	P38730	149 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	RIM4	P38741	713 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	THI6	P41835	540 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	RTS3	P53289	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	TEP1	P53916	434 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	UBX4	P54730	416 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
POP8	YBL018C	TPK2	P06245	380 aa		4.83	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	ACS1	Q01574	713 aa		4.83	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	TRS31	Q03337	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	ENT2	Q05785	613 aa		4.83	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	STE12	P13574	688 aa		4.82	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	CCL1	P37366	393 aa		4.82	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	YEL020C	P39994	560 aa		4.82	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	POL31	P46957	487 aa		4.82	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	COS12	P53053	380 aa		4.82	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	AAD4	Q07747	329 aa		4.82	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	VPS34	P22543	875 aa		4.81	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	APM3	P38153	483 aa		4.81	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	YIL166C	P40445	542 aa		4.81	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	YGL117W	P53133	265 aa		4.81	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	HIM1	Q06674	414 aa		4.81	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	CRD1	Q07560	283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	BET2	P20133	325 aa		4.8	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	ADY2	P25613	283 aa		4.8	□□□□□ -1.64
POP8	YBL018C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64

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