RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pde6dO55057 150 aa10.9□□□□□ -0.66
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc25a5P51881 298 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1044Q8VGR9 314 aa10.9□□□□□ -0.66
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9CRC3 126 aa10.9□□□□□ -0.66
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr905L7N1X5 310 aa10.9□□□□□ -0.66
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp58P16372 489 aa10.9□□□□□ -0.66
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdk2P97377 346 aa10.9□□□□□ -0.66
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ErasQ7TN89 227 aa10.9□□□□□ -0.66
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1371Q7TQT7 311 aa10.9□□□□□ -0.66
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf182Q8C432 247 aa10.9□□□□□ -0.66
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H3f3cP02301 136 aa10.9□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ube2l3P68037 154 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H3f3aP84244 136 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1370Q8VFG4 316 aa10.9□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aurkaip1Q9DCJ7 200 aa10.9□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plxna4Q80UG2 1893 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm12886B1AZM5 119 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H2-T22Q31615 379 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q6PIU9 354 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp874bQ7M6X2 447 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf24Q8BGI1 148 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxn4Q8K3Q3 521 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tlcd2Q8VC26 310 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Golt1bQ9CR60 138 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr685A0A1L1SVG7 331 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zcchc24B2RVL6 241 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm2381G3UY53 305 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mmp9P41245 730 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd84Q18PI6 329 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mettl4Q3U034 471 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lyplal1Q3UFF7 239 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1211Q7TR09 311 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdyhv1Q80WB5 209 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mien1Q9CQ86 115 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ManfQ9CXI5 179 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CadB2RQC6 2225 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm11756A2BEJ1 356 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm16519F8VQK7 162 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cxcl1P12850 96 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Crispld2Q8BZQ2 495 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1183Q8VFF8 303 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sh2d6Q9D413 297 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Egr4Q9WUF2 478 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Med12A2AGH6 2190 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wnk2Q3UH66 2149 aa10.89□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv14-126A0A075B5K0 117 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01796 113 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01797 113 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01799 113 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spam1P48794 512 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1810024B03RikQ8BWE1 200 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm16503Q8C6M9 103 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf115Q9D0C1 305 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rhebl1Q9D8T3 184 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 D930048N14RikA2AA67 225 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 F13bQ07968 669 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q149G0 166 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tgfbr1Q64729 503 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrps36Q9CQX8 102 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm12728V9GX31 77 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr204E9Q8M0 305 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ifna4P07351 186 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P18530 117 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr470Q8VF65 314 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9D7E4 109 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr624F8VQI7 308 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxa2P35583 459 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl8P62918 257 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fa2hQ5MPP0 372 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AgerQ62151 402 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atpaf1Q811I0 324 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc10Q8K3W2 274 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rasl11bQ922H7 247 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TecrQ9CY27 308 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr159Q9QZ19 319 aa10.88□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm572B1ARY8 399 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CrygsO35486 178 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rag2P21784 527 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dhrs9Q58NB6 319 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ercc8Q8CFD5 397 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr508Q8VG42 310 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxw4Q9JMJ2 410 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spry4Q9WTP2 300 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Esp23A8R0V5 104 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Npffr1E9Q468 432 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tpt1P63028 172 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pax5Q02650 391 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spcs3Q6ZWQ7 180 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Msrb2Q78J03 175 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab11fip5Q8R361 645 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr830Q8VFJ5 315 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr262Q8VFV8 312 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr346Q8VGJ7 309 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr577Q8VH11 312 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dph7Q9CYU6 477 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wbp2nlQ9D529 359 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nubp1Q9R060 320 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav15-2-dv6-2A0A075B650 123 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21778A0A087WNP8 232 aa10.87□□□□□ -0.67
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1024A2ASU7 327 aa10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.3 ms