Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Mmp9P41245 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Mmp9P41245 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mmp9P41245 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Mmp9P41245 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mmp9P41245 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mmp9P41245 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Mmp9P41245 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mmp9P41245 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mmp9P41245 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mmp9P41245 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mmp9P41245 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mmp9P41245 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mmp9P41245 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mmp9P41245 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mmp9P41245 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mmp9P41245 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mmp9P41245 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mmp9P41245 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mmp9P41245 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mmp9P41245 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Mmp9P41245 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mmp9P41245 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Mmp9P41245 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mmp9P41245 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mmp9P41245 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp9P41245 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp9P41245 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp9P41245 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mmp9P41245 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp9P41245 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp9P41245 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mmp9P41245 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp9P41245 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp9P41245 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp9P41245 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmp9P41245 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp9P41245 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp9P41245 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp9P41245 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp9P41245 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp9P41245 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp9P41245 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp9P41245 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp9P41245 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp9P41245 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp9P41245 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp9P41245 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp9P41245 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp9P41245 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp9P41245 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp9P41245 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp9P41245 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp9P41245 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp9P41245 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mmp9P41245 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mmp9P41245 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mmp9P41245 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mmp9P41245 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Mmp9P41245 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mmp9P41245 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp9P41245 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp9P41245 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp9P41245 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp9P41245 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp9P41245 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp9P41245 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp9P41245 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp9P41245 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp9P41245 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp9P41245 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp9P41245 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp9P41245 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp9P41245 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp9P41245 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp9P41245 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp9P41245 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp9P41245 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp9P41245 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp9P41245 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp9P41245 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp9P41245 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp9P41245 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp9P41245 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp9P41245 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp9P41245 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp9P41245 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp9P41245 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp9P41245 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp9P41245 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp9P41245 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp9P41245 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp9P41245 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp9P41245 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp9P41245 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mmp9P41245 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp9P41245 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp9P41245 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp9P41245 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp9P41245 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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