Protein–RNA interactions for Protein: P35583

Foxa2, Hepatocyte nuclear factor 3-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxa2P35583 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Foxa2P35583 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Foxa2P35583 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Foxa2P35583 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Foxa2P35583 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Foxa2P35583 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Foxa2P35583 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Foxa2P35583 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Foxa2P35583 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Foxa2P35583 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Foxa2P35583 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Foxa2P35583 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Foxa2P35583 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Foxa2P35583 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Foxa2P35583 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Foxa2P35583 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Foxa2P35583 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Foxa2P35583 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Foxa2P35583 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Foxa2P35583 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Foxa2P35583 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Foxa2P35583 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Foxa2P35583 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Foxa2P35583 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Foxa2P35583 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Foxa2P35583 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Foxa2P35583 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Foxa2P35583 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Foxa2P35583 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Foxa2P35583 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Foxa2P35583 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Foxa2P35583 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Foxa2P35583 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Foxa2P35583 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Foxa2P35583 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Foxa2P35583 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Foxa2P35583 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Foxa2P35583 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Foxa2P35583 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Foxa2P35583 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Foxa2P35583 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Foxa2P35583 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Foxa2P35583 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Foxa2P35583 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Foxa2P35583 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Foxa2P35583 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Foxa2P35583 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Foxa2P35583 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Foxa2P35583 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Foxa2P35583 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Foxa2P35583 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxa2P35583 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Foxa2P35583 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Foxa2P35583 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Foxa2P35583 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxa2P35583 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Foxa2P35583 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Foxa2P35583 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Foxa2P35583 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Foxa2P35583 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Foxa2P35583 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxa2P35583 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Foxa2P35583 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxa2P35583 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxa2P35583 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxa2P35583 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxa2P35583 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxa2P35583 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Foxa2P35583 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Foxa2P35583 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxa2P35583 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Foxa2P35583 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxa2P35583 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxa2P35583 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxa2P35583 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxa2P35583 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxa2P35583 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxa2P35583 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxa2P35583 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Foxa2P35583 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxa2P35583 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxa2P35583 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxa2P35583 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxa2P35583 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxa2P35583 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxa2P35583 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxa2P35583 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxa2P35583 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Foxa2P35583 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxa2P35583 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxa2P35583 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxa2P35583 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxa2P35583 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxa2P35583 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxa2P35583 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxa2P35583 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxa2P35583 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Foxa2P35583 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxa2P35583 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxa2P35583 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms