Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMJ2

Fbxw4, F-box/WD repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw4Q9JMJ2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Fbxw4Q9JMJ2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fbxw4Q9JMJ2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fbxw4Q9JMJ2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fbxw4Q9JMJ2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Fbxw4Q9JMJ2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fbxw4Q9JMJ2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fbxw4Q9JMJ2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fbxw4Q9JMJ2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fbxw4Q9JMJ2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fbxw4Q9JMJ2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fbxw4Q9JMJ2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Fbxw4Q9JMJ2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fbxw4Q9JMJ2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fbxw4Q9JMJ2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fbxw4Q9JMJ2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fbxw4Q9JMJ2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Fbxw4Q9JMJ2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbxw4Q9JMJ2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fbxw4Q9JMJ2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fbxw4Q9JMJ2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fbxw4Q9JMJ2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbxw4Q9JMJ2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbxw4Q9JMJ2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbxw4Q9JMJ2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbxw4Q9JMJ2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbxw4Q9JMJ2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbxw4Q9JMJ2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbxw4Q9JMJ2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbxw4Q9JMJ2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxw4Q9JMJ2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbxw4Q9JMJ2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbxw4Q9JMJ2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fbxw4Q9JMJ2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fbxw4Q9JMJ2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fbxw4Q9JMJ2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fbxw4Q9JMJ2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbxw4Q9JMJ2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fbxw4Q9JMJ2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fbxw4Q9JMJ2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fbxw4Q9JMJ2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxw4Q9JMJ2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxw4Q9JMJ2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fbxw4Q9JMJ2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fbxw4Q9JMJ2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbxw4Q9JMJ2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxw4Q9JMJ2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxw4Q9JMJ2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxw4Q9JMJ2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxw4Q9JMJ2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxw4Q9JMJ2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxw4Q9JMJ2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxw4Q9JMJ2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxw4Q9JMJ2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxw4Q9JMJ2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxw4Q9JMJ2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxw4Q9JMJ2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxw4Q9JMJ2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxw4Q9JMJ2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxw4Q9JMJ2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxw4Q9JMJ2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxw4Q9JMJ2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxw4Q9JMJ2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxw4Q9JMJ2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxw4Q9JMJ2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fbxw4Q9JMJ2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxw4Q9JMJ2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fbxw4Q9JMJ2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fbxw4Q9JMJ2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fbxw4Q9JMJ2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fbxw4Q9JMJ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbxw4Q9JMJ2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fbxw4Q9JMJ2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fbxw4Q9JMJ2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fbxw4Q9JMJ2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fbxw4Q9JMJ2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fbxw4Q9JMJ2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fbxw4Q9JMJ2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxw4Q9JMJ2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxw4Q9JMJ2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxw4Q9JMJ2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxw4Q9JMJ2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxw4Q9JMJ2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxw4Q9JMJ2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxw4Q9JMJ2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxw4Q9JMJ2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxw4Q9JMJ2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxw4Q9JMJ2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fbxw4Q9JMJ2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxw4Q9JMJ2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxw4Q9JMJ2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxw4Q9JMJ2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fbxw4Q9JMJ2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxw4Q9JMJ2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxw4Q9JMJ2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Fbxw4Q9JMJ2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxw4Q9JMJ2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fbxw4Q9JMJ2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxw4Q9JMJ2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fbxw4Q9JMJ2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms