RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C STE13P33894 931 aa7.33□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C SAP190P36123 1033 aa7.33□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C PPX1P38698 397 aa7.33□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C CRP1P38845 465 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C PSY2P40164 858 aa7.33□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C PYK2P52489 506 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C ESBP6P53918 673 aa7.33□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C YMR206WQ03695 313 aa7.33□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C VMS1Q04311 632 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C SPO75Q07798 868 aa7.33□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C CCR4P31384 837 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C ADE17P38009 592 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C WSC4P38739 605 aa7.32□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C EXO1P39875 702 aa7.32□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C RPT2P40327 437 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C PHO86P46956 311 aa7.32□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C MRX6P48564 524 aa7.32□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C VEL1P53058 206 aa7.32□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C GFD1Q04839 188 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C NDD1Q08887 554 aa7.32□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C AIM44Q99299 758 aa7.32□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C TRS33Q99394 268 aa7.32□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C CAP1P28495 268 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C SRX1P36077 127 aa7.31□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C BAT1P38891 393 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C YEL075CP39972 122 aa7.31□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C YJR061WP40355 935 aa7.31□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C RTT101P47050 842 aa7.31□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C HOP2P53187 214 aa7.31□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C PEX13P80667 386 aa7.31□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C SMA1Q02651 245 aa7.31□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C HEL2Q05580 639 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C YDL129WQ07555 291 aa7.31□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C HMI1Q12039 706 aa7.31□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C ARP7Q12406 477 aa7.31□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C CDC37P06101 506 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C CDC33P07260 213 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C HSF1P10961 833 aa7.3□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C GSY2P27472 705 aa7.3□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C MET22P32179 357 aa7.3□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C PYC2P32327 1180 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C UTH1P36135 365 aa7.3□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C YJR079WP47126 109 aa7.3□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C COP1P53622 1201 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C SIL1Q08199 421 aa7.3□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C YOL098CQ12496 1037 aa7.3□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C CYC8P14922 966 aa7.29□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C ARF2P19146 181 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C YIH1P25637 258 aa7.29□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C YJU3P28321 313 aa7.29□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C ABD1P32783 436 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C RPC25P35718 212 aa7.29□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C PXL1P36166 706 aa7.29□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C RRM3P38766 723 aa7.29□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C UBP7P40453 1071 aa7.29□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C STU2P46675 888 aa7.29□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C YNL144CP53907 740 aa7.29□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C YLR012CQ07927 99 aa7.29□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C APC11Q12157 165 aa7.29□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C YRR1Q12172 810 aa7.29□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C SEC6P32844 805 aa7.28□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C TYE7P33122 291 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C YET1P35723 206 aa7.28□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C MRPL40P36534 297 aa7.28□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C QNS1P38795 714 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C TRM112P53738 135 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C YMR187CQ03236 431 aa7.28□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C LCB5Q06147 687 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SPE3YPR069C PYC1P11154 1178 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C PUT4P15380 627 aa7.27□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C EST1P17214 699 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C RML2P32611 393 aa7.27□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C SRB2P34162 210 aa7.27□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C YAP5P40574 245 aa7.27□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C BST1P43571 1029 aa7.27□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C RSM7P47150 247 aa7.27□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C PRP24P49960 444 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C HAP5Q02516 242 aa7.27□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C OPT2Q06593 877 aa7.27□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C THI20Q08224 551 aa7.27□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C CIR2Q08822 631 aa7.27□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data7.27□□□□□ -1.25not detected
SPE3YPR069C EMP46Q12396 444 aa7.27□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C BI2P03873 423 aa7.26□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C NPR3P38742 1146 aa7.26□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C MIP6P38760 659 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C SAK1P38990 1142 aa7.26□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C SNZ3P43545 298 aa7.26□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C SNZ2P53824 298 aa7.26□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C RPN4Q03465 531 aa7.26□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C AIM39Q08223 395 aa7.26□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C RSB1Q08417 382 aa7.26□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C BI3Q9ZZW7 517 aa7.26□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C GCN1P33892 2672 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SPE3YPR069C PRP8P33334 2413 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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