RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRX1	YOL077C	MUP3	P38734	546 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	YEL020C	P39994	560 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	TMN3	P40071	706 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	PEA2	P40091	420 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	PMT6	P42934	759 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	SPC105	P53148	917 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	IZH3	Q07959	543 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	AIM41	Q12032	185 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
BRX1	YOL077C	TMA17	Q12513	150 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	ADY2	P25613	283 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	EMP70	P32802	667 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	PPE1	P38796	400 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
BRX1	YOL077C	FTR1	P40088	404 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	PRM2	P40534	656 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	THI6	P41835	540 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	HLR1	Q04429	423 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	TUP1	P16649	713 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	HXT4	P32467	576 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	NIT2	P47016	307 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	TIM50	Q02776	476 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	GIS1	Q03833	894 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	KAR1	P11927	433 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	STE12	P13574	688 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	PEX2	P32800	271 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	YBR071W	P38243	211 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	ATF1	P40353	525 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	SLD3	P53135	668 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	YCG1	Q06680	1035 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	BNR1	P40450	1375 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	HMG2	P12684	1045 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	ATP12	P22135	325 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	YMC2	P38087	329 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	EMP65	P40085	556 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	YJR120W	P47157	116 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	MRK1	P50873	501 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	SNF12	P53628	566 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	MFM1	Q02783	413 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	TRS23	Q03784	219 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	ARO10	Q06408	635 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	PHO5	P00635	467 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	CDS1	P38221	457 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	EHT1	P38295	451 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	RIM4	P38741	713 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	PIH1	P38768	344 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	MDR1	P53258	950 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRX1	YOL077C	TPK2	P06245	380 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	MRC1	P25588	1096 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	MTC7	P32633	139 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	MRPL7	P36519	292 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	PAF1	P38351	445 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	YEL076C	P39971	216 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	MIT1	P40002	666 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	PEX14	P53112	341 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	HOL1	P53389	586 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	COG6	P53959	839 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	PEX15	Q08215	383 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	SEC12	P11655	471 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	STE4	P18851	423 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	TFC4	P33339	1025 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	PAC2	P39937	518 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	IRC5	P43610	853 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	ATG36	P46983	293 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	YIP4	P53093	235 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRX1	YOL077C	PEF1	P53238	335 aa		4.07	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39 ms