RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	MRK1	P50873	501 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	VPS62	P53285	467 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	YNL260C	P53846	198 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	ACL4	Q03771	387 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	THI20	Q08224	551 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	OCA6	Q12454	224 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	SIR1	P21691	654 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	SPO11	P23179	398 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	NPP1	P25353	742 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	ATP7	P30902	174 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	MLS1	P30952	554 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	GUT1	P32190	709 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	VPH2	P32341	215 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	MMS4	P38257	691 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.41	□□□□□ -1.86	RIP-Chip
RRP5	YMR229C	YJL007C	P47080	104 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	YGR117C	P53270	476 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	YLR407W	Q06070	228 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	SEC10	Q06245	871 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	OPT2	Q06593	877 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	AEP2	P22136	580 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	AIM23	P47015	356 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	HLJ1	P48353	224 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	YML119W	Q03208	357 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	GRX3	Q03835	250 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	RSB1	Q08417	382 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	KTR2	P33550	425 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	ASK1	P35734	292 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	GIP1	P38229	639 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	NPR2	P39923	615 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	TGL3	P40308	642 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	CAB2	P40506	365 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	YGR111W	P53265	400 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	PRM6	Q04705	352 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	NDL1	Q06568	189 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	SVS1	Q12254	260 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	YER152C	P10356	443 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	SEC15	P22224	910 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	NUP120	P35729	1037 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	YGL176C	P46945	554 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	SRB7	P47822	140 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	ISM1	P48526	1002 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	SPC2	Q04969	178 aa		3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
RRP5	YMR229C	GPA2	P10823	449 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PTC4	P38089	393 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PET100	P38958	111 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PRM9	P39551	298 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ALG5	P40350	334 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.4	□□□□□ -1.87	not detected
RRP5	YMR229C	SWP82	P43554	623 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	GIM3	P53900	129 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TGL2	P54857	326 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	PLP1	Q04004	230 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SND1	Q04007	877 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YOL075C	Q08234	1294 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ACM1	Q08981	209 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YRR1	Q12172	810 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MSH5	Q12175	901 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TRM11	Q12463	433 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	VAC17	P25591	423 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TCA17	P32613	152 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SPC34	P36131	295 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	CDC27	P38042	758 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	REG2	P38232	338 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	YBR062C	P38239	180 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TDA3	P38758	523 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	KHA1	P40309	873 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	EFM4	P40516	257 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ROG3	P43602	733 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	NUT1	P53114	1132 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	MSC2	Q03455	724 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ADI1	Q03677	179 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ARO80	Q04052	950 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	LSO1	Q3E827	93 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	REP1	P03871	373 aa		3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
RRP5	YMR229C	STB6	P36085	766 aa		3.4	□□□□□ -1.87

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