RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	YJR120W	P47157	116 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	DIP5	P53388	608 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	SPC98	P53540	846 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	HLR1	Q04429	423 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	RKI1	Q12189	258 aa		3.89	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	LAM4	P38800	1345 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	TUP1	P16649	713 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	ATP12	P22135	325 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	HXT4	P32467	576 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	ELF1	P36053	145 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	CDS1	P38221	457 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	PAF1	P38351	445 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	3.88	□□□□□ -1.79	not detected
YCT1	YLL055W	FTR1	P40088	404 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	SPC105	P53148	917 aa		3.88	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	MRC1	P25588	1096 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	EMP70	P32802	667 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	SNF12	P53628	566 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	COG6	P53959	839 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	UFO1	Q04511	668 aa		3.87	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	RPN13	O13563	156 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	SPO11	P23179	398 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	MTC7	P32633	139 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	PPZ2	P33329	710 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	MUP3	P38734	546 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	YEL020C	P39994	560 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	PEA2	P40091	420 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	SLD3	P53135	668 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	TIM50	Q02776	476 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	AIM41	Q12032	185 aa		3.86	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	HMG2	P12684	1045 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	PPE1	P38796	400 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	EMP65	P40085	556 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	PMT6	P42934	759 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	YCG1	Q06680	1035 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	YMC2	P38087	329 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	MIT1	P40002	666 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	THI6	P41835	540 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	FOL1	P53848	824 aa		3.85	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
YCT1	YLL055W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	KAR1	P11927	433 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	ADY2	P25613	283 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	YEL076C	P39971	216 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	YEL025C	P39991	1188 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	IRC5	P43610	853 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	PEX14	P53112	341 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	PEF1	P53238	335 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		3.84	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	PHO5	P00635	467 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	TFC4	P33339	1025 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	MRPL7	P36519	292 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	EHT1	P38295	451 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	YDL183C	P48569	320 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	HOL1	P53389	586 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	ARO10	Q06408	635 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	PEX15	Q08215	383 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	BNR1	P40450	1375 aa		3.83	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	STE12	P13574	688 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	STE4	P18851	423 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	PLC1	P32383	869 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	ATF1	P40353	525 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	MRK1	P50873	501 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	MFM1	Q02783	413 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	TRS23	Q03784	219 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	GIS1	Q03833	894 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	YOR378W	Q08902	515 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	VPS5	Q92331	675 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	TPK2	P06245	380 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	PAC2	P39937	518 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	EAF5	P39995	279 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	LRO1	P40345	661 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YCT1	YLL055W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.4 ms