RNA–Protein interactions for RNA: YLL003W

SFI1, Transcript of Centrin (Cdc31p)-binding protein required for SPB duplication, yeast

Gene SFI1, Length 2,841 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SFI1	YLL003W	ARP7	Q12406	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
SFI1	YLL003W	OM45	P16547	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	ALG1	P16661	449 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SFL1	P20134	766 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PHO3	P24031	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	KCC4	P25389	1037 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CCZ1	P38273	704 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YHR219W	P38900	624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CNN1	P43618	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YML6	P51998	286 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MUK1	Q02866	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	ARP10	Q04549	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RTT103	Q05543	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PHO92	Q06390	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RSC58	Q07979	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MED2	Q12124	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RTR2	Q12378	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YOS9	Q99220	542 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MPD2	Q99316	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PHO8	P11491	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SDH2	P21801	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	DMC1	P25453	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	APL1	P27351	700 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YHI9	P38765	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TAF4	P50105	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TAF12	Q03761	539 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	DXO1	Q06349	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SPO21	Q12411	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	LAG2	Q92325	660 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	ARG81	P05085	880 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	FBP1	P09201	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	GCN3	P14741	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	VPS17	P32913	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	UFE1	P41834	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SPE2	P21182	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	NUP133	P36161	1157 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MRPL37	P36532	105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RRT14	P40470	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YNR061C	P53747	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	ORC4	P54791	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	DDC1	Q08949	612 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	DIN7	Q12086	430 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	WHI2	P12611	486 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	STE12	P13574	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	NPP1	P25353	742 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CDC15	P27636	974 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	COS111	P38308	924 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	IPL1	P38991	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CCC2	P38995	1004 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CAB2	P40506	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	SPO74	P45819	413 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	GNP1	P48813	663 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TEL2	P53038	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	TOF1	P53840	1238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RCM1	P53972	490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	UBX4	P54730	416 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	ATG13	Q06628	738 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	NDE2	Q07500	545 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PSR2	Q07949	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	AEP3	Q12089	606 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	PDR11	P40550	1411 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RAD1	P06777	1100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	NAM9	P27929	486 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1	YLL003W	RGD1	P38339	666 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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