RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	ALG7	P07286	448 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	PEX1	P24004	1043 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	BCD1	P38772	366 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	NUP60	P39705	539 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	IES1	P43579	692 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	SLD3	P53135	668 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	PEX8	P53248	589 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	KIN4	Q01919	800 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	SND1	Q04007	877 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	STP4	Q07351	490 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	IRC13	Q08630	104 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.1	□□□□□ -1.59	not detected
MTD1	YKR080W	USO1	P25386	1790 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	CDC26	P14724	124 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	PXA1	P41909	870 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	UBC11	P52492	156 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	THI22	Q06490	572 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	PEX15	Q08215	383 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	YOL073C	Q08232	322 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MTD1	YKR080W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	IME1	P21190	360 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	REV7	P38927	245 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	FMP52	P40008	231 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	BIT61	P47041	543 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	YJR008W	P47085	338 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	SUN4	P53616	420 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	PPN1	Q04119	674 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	PHM6	Q05637	104 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	POM34	Q12445	299 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	YSP2	Q06681	1438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	ATP12	P22135	325 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	SEC15	P22224	910 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	KIN82	P25341	720 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	DGR2	P32330	852 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	HXT4	P32467	576 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	YPT7	P32939	208 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	PEA2	P40091	420 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	BUD8	P41698	603 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	MSE1	P48525	536 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	YNL034W	P53963	612 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	YNL018C	P53976	612 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
MTD1	YKR080W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	HIR1	P32479	840 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	PPS1	P38148	807 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	TAF4	P50105	388 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	NSE5	Q03718	556 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	YOL057W	Q08225	711 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	PUS9	Q12069	462 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	SFB3	P38810	929 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	PIG2	P40187	538 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	TGL2	P54857	326 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	MPD2	Q99316	277 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	IML1	P47170	1584 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	SIR3	P06701	978 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	BCS1	P32839	456 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	SEC6	P32844	805 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
MTD1	YKR080W	YIL077C	P40508	320 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	DAS1	P47005	663 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	TEL2	P53038	688 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	YAP1802	P53309	568 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	HOL1	P53389	586 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	SPO1	P53541	631 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	RIA1	P53893	1110 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	SLX4	Q12098	748 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	ZRT2	Q12436	422 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	YHR033W	P38690	423 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	YMR206W	Q03695	313 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	YFT2	Q06676	274 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MTD1	YKR080W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	YLR464W	P0CX17	216 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	PRP28	P23394	588 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	PRE4	P30657	266 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	PHO11	P35842	467 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	COS111	P38308	924 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	PHO12	P38693	467 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	CHS7	P38843	316 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MTD1	YKR080W	YEL076C	P39971	216 aa		5.02	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 81 ms