RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C PRM2P40534 656 aa3.65□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C DIP5P53388 608 aa3.65□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C SNF12P53628 566 aa3.65□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C APM1Q00776 475 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C FDC1Q03034 503 aa3.65□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C SKY1Q03656 742 aa3.65□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C UFO1Q04511 668 aa3.65□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data3.65□□□□□ -1.83not detected
CSE4YKL049C LAM4P38800 1345 aa3.65□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C RPN13O13563 156 aa3.64□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C TUP1P16649 713 aa3.64□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C ATP12P22135 325 aa3.64□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C AEP2P22136 580 aa3.64□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C ADY2P25613 283 aa3.64□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C ELF1P36053 145 aa3.64□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C YHR033WP38690 423 aa3.64□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C YEL020CP39994 560 aa3.64□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C FTR1P40088 404 aa3.64□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C NIT2P47016 307 aa3.64□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C TIM50Q02776 476 aa3.64□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C HLR1Q04429 423 aa3.64□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C TMA17Q12513 150 aa3.64□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C BNR1P40450 1375 aa3.63□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C HXT4P32467 576 aa3.63□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C CUE2P36075 443 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C YMC2P38087 329 aa3.63□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C YBR071WP38243 211 aa3.63□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C RIX1P38883 763 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C ATF1P40353 525 aa3.63□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C PMT6P42934 759 aa3.63□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C YJR120WP47157 116 aa3.63□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C NGL1Q08213 363 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C AIM41Q12032 185 aa3.63□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C MDM20Q12387 796 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C TUB1P09733 447 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C STE12P13574 688 aa3.62□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C MTC7P32633 139 aa3.62□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C CDS1P38221 457 aa3.62□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C PPE1P38796 400 aa3.62□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C MIT1P40002 666 aa3.62□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C PEA2P40091 420 aa3.62□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C YGR054WP53235 642 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C DAK1P54838 584 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C NGL2Q03264 515 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C YDR179W-AQ03983 463 aa3.62□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C ARO10Q06408 635 aa3.62□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C YCG1Q06680 1035 aa3.62□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C PHO5P00635 467 aa3.61□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C HMG2P12684 1045 aa3.61□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C COX11P19516 300 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C ILV6P25605 309 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C PEX2P32800 271 aa3.61□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C SRP68P38687 599 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C THI6P41835 540 aa3.61□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C SPC105P53148 917 aa3.61□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C LGE1Q02796 332 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C TRS23Q03784 219 aa3.61□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C STE4P18851 423 aa3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C DHR2P36009 735 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C FLO10P36170 1169 aa3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C MRPL7P36519 292 aa3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C EHT1P38295 451 aa3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C PAF1P38351 445 aa3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C YEL025CP39991 1188 aa3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C YDL183CP48569 320 aa3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C ASN1P49089 572 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C MRK1P50873 501 aa3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C SQS1P53866 767 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C COG6P53959 839 aa3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C MFM1Q02783 413 aa3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C EFR3Q03653 782 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C NDJ1Q12366 352 aa3.6□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C TPK2P06245 380 aa3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C YEL076C-AP0CX16 216 aa3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C YLR464WP0CX17 216 aa3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C SSB1P11484 613 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C KAR1P11927 433 aa3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C RPA135P22138 1203 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C RMA1P36001 430 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C PAC2P39937 518 aa3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C YEL076CP39971 216 aa3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C EMP65P40085 556 aa3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C SSB2P40150 613 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C IRC5P43610 853 aa3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C YIP4P53093 235 aa3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C SLD3P53135 668 aa3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C PEF1P53238 335 aa3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C PEX15Q08215 383 aa3.59□□□□□ -1.83
CSE4YKL049C TUF1P02992 437 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CSE4YKL049C SAT4P25333 603 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CSE4YKL049C MRC1P25588 1096 aa3.58□□□□□ -1.84
CSE4YKL049C HEM12P32347 362 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CSE4YKL049C UGP1P32861 499 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CSE4YKL049C TFC4P33339 1025 aa3.58□□□□□ -1.84
CSE4YKL049C ENP1P38333 483 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CSE4YKL049C PEX14P53112 341 aa3.58□□□□□ -1.84
CSE4YKL049C IMO32P53219 342 aa3.58□□□□□ -1.84
CSE4YKL049C MTD1Q02046 320 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
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