RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSA4	YER103W	PRM6	Q04705	352 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	FMP42	Q04991	504 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	ASA1	Q06822	443 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	NTO1	Q12311	748 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	HSF1	P10961	833 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	SAN1	P22470	610 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	PRE8	P23639	250 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	TPO5	P36029	618 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	YDR089W	P38966	869 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	SAD1	P43589	448 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	COG2	P53271	262 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	AAD16	Q02895	342 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	TFB3	Q03290	321 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	RAD30	Q04049	632 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	SMP3	Q04174	516 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	LAM6	Q08001	693 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	YIG1	Q08956	461 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SSA4	YER103W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	RRN3	P36070	627 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	LSB1	P53281	241 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	DIP5	P53388	608 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	SKG3	Q06315	1026 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	MCM21	Q06675	368 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	MCH5	Q08777	521 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	YDR018C	Q12185	396 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	YDR239C	Q03780	787 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	GCN3	P14741	305 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	ADP1	P25371	1049 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	FAR3	P46671	204 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	YGL176C	P46945	554 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	MAD3	P47074	515 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	YTP1	P53584	459 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	ARK1	P53974	638 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	VCX1	Q99385	411 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	TEC1	P18412	486 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	DAL2	P25335	343 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	CHS6	P40955	746 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	IVY1	Q04934	453 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	ATG26	Q06321	1198 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	CUR1	Q06469	252 aa		13.12	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	AFG2	P32794	780 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	PET112	P33893	541 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	ERC1	P38767	581 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	DSE1	P40077	573 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	TEP1	P53916	434 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	ORC4	P54791	529 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	SAS4	Q04003	481 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	YET2	Q04210	160 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.11	□□□□□ -0.31	not detected
SSA4	YER103W	SRD1	P09007	221 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	PUS6	P53294	404 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	FMP30	Q02883	468 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	SND1	Q04007	877 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	HRT3	Q12347	344 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	STB3	Q12427	513 aa		13.11	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	BRF1	P29056	596 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	SPR1	P32603	445 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	YBR138C	P38277	524 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	APE4	P38821	490 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	NDT80	P38830	627 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	SWP82	P43554	623 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	MMT1	Q03218	510 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	GPI17	Q04080	534 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	VAM6	Q07468	1049 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	RIF1	P29539	1916 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	GIP1	P38229	639 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	POL31	P46957	487 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	FAP1	P53971	965 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	SPC2	Q04969	178 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	YDL114W	Q07530	308 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	COR1	P07256	457 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	UBP7	P40453	1071 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	PHO86	P46956	311 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	COQ9	Q05779	260 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	SMC5	Q08204	1093 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSA4	YER103W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SSA4	YER103W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.3 ms