RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C DNF3Q12674 1656 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PDR11P40550 1411 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RPB2P08518 1224 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C BIK1P11709 440 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C IME1P21190 360 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
DOA4YDR069C SEC21P32074 935 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C VMA8P32610 256 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PTR2P32901 601 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C CNS1P33313 385 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MOT2P34909 587 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C APL2P36000 726 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SAF1P38352 637 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SEC31P38968 1273 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MMM1P41800 426 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RCM1P53972 490 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C BET4Q00618 327 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SRL4Q03085 281 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C DCS1Q06151 350 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ATG17Q06410 417 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
DOA4YDR069C RTP1Q12751 981 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SPS1P08458 490 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RNR2P09938 399 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C INO1P11986 533 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C CHS2P14180 963 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C DBP5P20449 482 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PEX1P24004 1043 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ITR1P30605 584 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MLS1P30952 554 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C WHI3P34761 661 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YER137CP40083 148 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SNL1P40548 159 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YFH7P43591 353 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TRS85P46944 698 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C HNT2P49775 206 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MTC5Q03897 1148 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RSM24Q03976 319 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TIF35Q04067 274 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SXM1Q04175 944 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C CRN1Q06440 651 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C NOP12Q08208 459 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C OCA6Q12454 224 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YOL098CQ12496 1037 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa3.32□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RAD53P22216 821 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C UGA2P38067 497 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YBR225WP38321 900 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RCK2P38623 610 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RRP8P38961 392 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TIF4631P39935 952 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MRX1P40050 688 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SCS2P40075 244 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C FAF1P40546 346 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MNT3P40549 630 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YJR079WP47126 109 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SSN8P47821 323 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TRF5P48561 642 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C OCA1P50946 238 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RBG2P53295 368 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C GIM3P53900 129 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C EMI2Q04409 500 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C DBP9Q06218 594 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YPL260WQ08977 551 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C IML1P47170 1584 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C KIP1P28742 1111 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ACP1P32463 125 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C KAE1P36132 386 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MAK5P38112 773 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C JLP2P40206 208 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C HUL4P40985 892 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C GCD10P41814 478 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TFG2P41896 400 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C LSB3P43603 459 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C CIT3P43635 486 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SPC24Q04477 213 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PIG1Q06216 648 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SMD2Q06217 110 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YLR177WQ06251 628 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SWA2Q06677 668 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PUS7Q08647 676 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SPO21Q12411 609 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YBL111CQ3E7Y5 667 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C USO1P25386 1790 aa3.31□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TY1B-HO13535 1793 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TY1B-JR1P47098 1755 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TY1B-ER1Q03612 1755 aa3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TY1B-GR2Q12269 1755 aa3.3□□□□□ -1.88
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