RNA–Protein interactions for RNA: YPL226W

NEW1, Transcript of ATP binding cassette protein, yeast

Gene NEW1, Length 3,591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEW1	YPL226W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	YNR061C	P53747	219 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	PSR2	Q07949	397 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	MPD2	Q99316	277 aa		2.75	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	TPK1	P06244	397 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	STE11	P23561	717 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	MET4	P32389	672 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	ISF1	P32488	338 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	MED6	P38782	295 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	TKL2	P33315	681 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	IES1	P43579	692 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	ALT1	P52893	592 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	VPS20	Q04272	221 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	DON1	Q05610	365 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	GPM2	Q12008	311 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	MED1	Q12321	566 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	SIR1	P21691	654 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	RDS1	P25611	832 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	TRK2	P28584	889 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	KIP1	P28742	1111 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	HIR1	P32479	840 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	UTR2	P32623	467 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	HER2	Q03557	464 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	WAR1	Q03631	944 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	PRM6	Q04705	352 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	HPF1	Q05164	967 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	YPQ1	Q12010	308 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	RPC31	P17890	251 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	MSH2	P25847	964 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	CDC15	P27636	974 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	RAD16	P31244	790 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	CSE1	P33307	960 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	SIF2	P38262	535 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	CHS6	P40955	746 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	TMN2	Q04562	672 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	MLH2	Q07980	695 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	TLG2	Q08144	397 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	TCO89	Q08921	799 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	WTM2	Q12206	467 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	NDJ1	Q12366	352 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	CHS2	P14180	963 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	PPH22	P23595	377 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	GAC1	P28006	793 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	GPI10	P30777	616 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	MSB2	P32334	1306 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	DAL1	P32375	460 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	YKR051W	P36142	418 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	YBR056W	P38081	501 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	AGP2	P38090	596 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	LCB2	P40970	561 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	YNL011C	P53980	444 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	TIM8	P57744	87 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	BSP1	Q06604	576 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	YPR027C	Q12079	277 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	CHS1	P08004	1131 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	SWI3	P32591	825 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	FRE1	P32791	686 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	LTV1	P34078	463 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	NUP60	P39705	539 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	NPA3	P47122	385 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	LYS5	P50113	272 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	NNF2	P53253	936 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	MUB1	Q03162	620 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	GCN5	Q03330	439 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	BIK1	P11709	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	BYE1	P36106	594 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	TCD1	P38756	429 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	GEM1	P39722	662 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	CWC24	P53769	259 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	YNL108C	P53929	270 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	FLC1	Q08967	793 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	YVC1	Q12324	675 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	GIS3	Q12418	502 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	GAL10	P04397	699 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	ROX1	P25042	368 aa		2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
NEW1	YPL226W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97

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