RNA–Protein interactions for RNA: YMR014W

BUD22, Transcript of Protein required for rRNA maturation and ribosomal subunit biogenesis, yeast

Gene BUD22, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD22	YMR014W	SPC72	P39723	622 aa		5.22	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	VPS4	P52917	437 aa		5.22	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	HUL5	P53119	910 aa		5.22	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	YAF9	P53930	226 aa		5.22	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	ERV41	Q04651	352 aa		5.22	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	DON1	Q05610	365 aa		5.22	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	YLR297W	Q05899	129 aa		5.22	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	MLH2	Q07980	695 aa		5.22	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	YVC1	Q12324	675 aa		5.22	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	ARP6	Q12509	438 aa		5.22	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	CLN3	P13365	580 aa		5.21	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	BLI1	P35727	113 aa		5.21	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	JNM1	P36224	373 aa		5.21	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	RCK2	P38623	610 aa		5.21	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	FIS1	P40515	155 aa		5.21	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	YMR018W	Q04364	514 aa		5.21	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	SUE1	Q06524	206 aa		5.21	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	OXR1	Q08952	273 aa		5.21	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	YPL216W	Q08964	1102 aa		5.21	□□□□□ -1.57
BUD22	YMR014W	CBP1	P07252	654 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	RAD18	P10862	487 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	TUP1	P16649	713 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	YSC83	P32792	385 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	XRS2	P33301	854 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	STV1	P37296	890 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	ACA1	P39970	489 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	RPC17	P47076	161 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	YJR039W	P47107	1121 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	KAP114	P53067	1004 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	YML037C	Q03703	340 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	YDL057W	Q07379	328 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	CSR2	Q12734	1121 aa		5.21	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	DEP1	P31385	405 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	TGL1	P34163	548 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	OCT1	P35999	772 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	VPS41	P38959	992 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	SAK1	P38990	1142 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	VAB2	P40003	282 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	MIC19	P43594	170 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	STE23	Q06010	1027 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	SPH1	Q06160	661 aa		5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	NFS1	P25374	497 aa		5.19	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	KIP1	P28742	1111 aa		5.19	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	PTC7	P38797	343 aa		5.19	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	JJJ1	P53863	590 aa		5.19	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	ECI1	Q05871	280 aa		5.19	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	HDA2	Q06629	674 aa		5.19	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	ZRT2	Q12436	422 aa		5.19	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	CLB1	P24868	471 aa		5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	SEC8	P32855	1065 aa		5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	GPB2	P39717	880 aa		5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	TAD1	P53065	400 aa		5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	SHE10	P53075	577 aa		5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	TIM8	P57744	87 aa		5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	SMC5	Q08204	1093 aa		5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	YDL177C	Q12257	170 aa		5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	RKM4	Q12504	494 aa		5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	YLR278C	Q05854	1341 aa		5.18	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.17	□□□□□ -1.58	not detected
BUD22	YMR014W	DAL7	P21826	554 aa		5.17	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	SQT1	P35184	431 aa		5.17	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	ATG19	P35193	415 aa		5.17	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	MMS21	P38632	267 aa		5.17	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	NDT80	P38830	627 aa		5.17	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	LCB2	P40970	561 aa		5.17	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	YGR045C	P53229	120 aa		5.17	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	MRPL22	P53881	309 aa		5.17	□□□□□ -1.58
BUD22	YMR014W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58

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