RNA–Protein interactions for RNA: YKL004W

AUR1, Transcript of Phosphatidylinositol:ceramide phosphoinositol transferase, yeast

Gene AUR1, Length 1,206 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AUR1	YKL004W	ZIP2	P53061	704 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AUR1	YKL004W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
AUR1	YKL004W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
AUR1	YKL004W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AUR1	YKL004W	SPE2	P21182	396 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AUR1	YKL004W	YJL163C	P46996	555 aa		4.66	□□□□□ -1.66
AUR1	YKL004W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AUR1	YKL004W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
AUR1	YKL004W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	DID4	P36108	232 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YKR018C	P36114	725 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YBR259W	P38338	688 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YFL052W	P43551	465 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	NPY1	P53164	384 aa		4.65	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	HMG1	P12683	1054 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
AUR1	YKL004W	MAL31	P38156	614 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	SDS3	P40505	327 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	RET2	P43621	546 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YJR096W	P47137	282 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	GPG1	P53130	126 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YML122C	Q03207	126 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	TGL5	Q12043	749 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	GPR1	Q12361	961 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.64	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	RIA1	P53893	1110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	ASM4	Q05166	528 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	IRC13	Q08630	104 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	TRE2	Q08693	809 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YBR071W	P38243	211 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YAP3	P38749	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	PCL5	P38794	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
AUR1	YKL004W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	MIH1	P23748	554 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	SIC1	P38634	284 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	TDA3	P38758	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	ECM1	P39715	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	HOS4	P40480	1083 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	BFA1	P47113	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	AIM14	P53109	570 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	PCL10	P53124	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YBP2	P53169	641 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	CDC45	Q08032	650 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	TMA17	Q12513	150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	APM4	Q99186	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	VMR1	P38735	1592 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	IML1	P47170	1584 aa		4.61	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	EUG1	P32474	517 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	EMP65	P40085	556 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	BAP3	P41815	604 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	UBC11	P52492	156 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	ORC4	P54791	529 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	SGO1	Q08490	590 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	PDR11	P40550	1411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.6	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	CDC43	P18898	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	AEP2	P22136	580 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	BCD1	P38772	366 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	FMP52	P40008	231 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YGR153W	P48238	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	SSL2	Q00578	843 aa		4.59	□□□□□ -1.67
AUR1	YKL004W	YKR051W	P36142	418 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AUR1	YKL004W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AUR1	YKL004W	REV7	P38927	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AUR1	YKL004W	GID8	P40208	455 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AUR1	YKL004W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AUR1	YKL004W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AUR1	YKL004W	FOL1	P53848	824 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AUR1	YKL004W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AUR1	YKL004W	GAD1	Q04792	585 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AUR1	YKL004W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
AUR1	YKL004W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AUR1	YKL004W	APT2	P36973	181 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AUR1	YKL004W	GRX7	P38068	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
AUR1	YKL004W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
AUR1	YKL004W	COG6	P53959	839 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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