RNA–Protein interactions for RNA: YJL034W

KAR2, Transcript of ATPase involved in protein import into the ER, yeast

Gene KAR2, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR2	YJL034W	KAR9	P32526	644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	TMT1	P32643	299 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	GYP6	P32806	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	RGT1	P32862	1170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	BSD2	P38356	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	PCA1	P38360	1216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	REV7	P38927	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YIL001W	P40560	513 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YML6	P51998	286 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	PUS2	P53167	370 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	HOP2	P53187	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	GTR1	Q00582	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YML119W	Q03208	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ACM1	Q08981	209 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	NCA2	Q12374	616 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ECM29	P38737	1868 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YUR1	P26725	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	TRM2	P33753	639 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	APM2	P38700	605 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	TMN3	P40071	706 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	TPO2	P53283	614 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YNL144C	P53907	740 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SFB2	P53953	876 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ATP25	Q03153	612 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	KRE28	Q04431	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	TAF10	Q12030	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	IOC2	Q12072	812 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	LAA1	P39526	2014 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	GAL10	P04397	699 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	WHI2	P12611	486 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	RGD2	P43556	714 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	PEX21	P50091	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ATG1	P53104	897 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YML020W	Q03722	664 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	GNT1	Q12096	491 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	MAS2	P11914	482 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	AEP2	P22136	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	MRPL25	P23369	157 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	KIP2	P28743	706 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	GPI10	P30777	616 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	TFC3	P34111	1160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	CDC27	P38042	758 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ARG2	P40360	574 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SUM1	P46676	1062 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	HLJ1	P48353	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	COG6	P53959	839 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	PRM6	Q04705	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ALR1	Q08269	859 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	MET7	Q08645	548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	NFI1	Q12216	726 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	OCA6	Q12454	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	PCD1	Q12524	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	RTP1	Q12751	981 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	POX1	P13711	748 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	HEM15	P16622	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	CBF1	P17106	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	BAS1	P22035	811 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	AFT1	P22149	690 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	NPL6	P32832	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	STE13	P33894	931 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ASH1	P34233	588 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	LHS1	P36016	881 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YMC2	P38087	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
KAR2	YJL034W	YHR054C	P38780	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	RSC30	P38781	883 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	TDA11	P38854	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	MXR1	P40029	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	KHA1	P40309	873 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	TMA108	P40462	946 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	AXL1	P40851	1208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SNZ3	P43545	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	ZIP2	P53061	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	MND1	P53102	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	SNZ2	P53824	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
KAR2	YJL034W	YNL108C	P53929	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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