RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A087WWV3 80 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF213O14771 459 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM177BA6PVY3 158 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CPLX1O14810 134 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PTGS1P23219 599 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FBXO3Q9UK99 471 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.52□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CTSWP56202 376 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TICAM2Q86XR7 235 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NCOA7Q8NI08 942 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KINO60870 393 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FSIP1Q8NA03 581 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C8orf76Q96K31 380 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC186Q7Z3E2 898 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LAMA4Q16363 1823 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ANTXR2P58335 489 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRDNQ13061 729 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RXRAP19793 462 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PHKA1P46020 1223 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ARID3AQ99856 593 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TPM3P06753 285 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1B0GVL5 298 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SNAP23O00161 211 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF75DP51815 510 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LRMPQ12912 555 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 STK38Q15208 465 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CLIC4Q9Y696 253 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BECN2A8MW95 431 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ADD2P35612 726 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC102BQ68D86 513 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TSC1Q92574 1164 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SDF4Q9BRK5 362 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PDE8BO95263 885 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPTLC3Q9NUV7 552 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PAPPAQ13219 1627 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 STX1AQ16623 288 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EXOC5O00471 708 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DYNC1I1O14576 645 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CTAGE5O15320 804 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PDE8AO60658 829 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EVCP57679 992 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATL3Q6DD88 541 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.47□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AIDAQ96BJ3 306 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms