RNA–Protein interactions for RNA: YOR295W

UAF30, Transcript of Subunit of UAF (upstream activation factor) complex, yeast

Gene UAF30, Length 687 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UAF30	YOR295W	PFA3	P42836	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	PIP2	P52960	996 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	SLD3	P53135	668 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	MET14	Q02196	202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	NYV1	Q12255	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	GAL1	P04385	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	OAF3	P36023	863 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	KTR4	P38131	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	RPP1	P38786	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	PCL10	P53124	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	CTF4	Q01454	927 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	YLR415C	O13578	112 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	KAR1	P11927	433 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	PTP2	P29461	750 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	NIC96	P34077	839 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	SUL1	P38359	859 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	BEM4	P39011	633 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	IES5	P40060	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	SPC105	P53148	917 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	UBX4	P54730	416 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	YHM2	Q04013	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	PHM6	Q05637	104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UAF30	YOR295W	SWI6	P09959	803 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	FUI1	P38196	639 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	PZF1	P39933	429 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	YGR021W	P53212	290 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	ARP4	P80428	489 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	PKH1	Q03407	766 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	ATG16	Q03818	150 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	ALG7	P07286	448 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	KCC4	P25389	1037 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	SEC65	P29478	273 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	YKL133C	P36066	463 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	FAT1	P38225	669 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	SIC1	P38634	284 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	ELO3	P40319	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	MUP1	P50276	574 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	MLC2	Q06580	163 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	PEX15	Q08215	383 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.82	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	DPB3	P27344	201 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	YKU70	P32807	602 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	YBR053C	P38235	358 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	GID8	P40208	455 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	BFA1	P47113	574 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	RNT1	Q02555	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	TGL5	Q12043	749 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
UAF30	YOR295W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	MOH1	P38191	138 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	MUK1	Q02866	612 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	NRG1	Q03125	231 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	DLT1	Q04216	342 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	FRE5	Q08908	694 aa		4.8	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	MET3	P08536	511 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	ATP12	P22135	325 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	RIM4	P38741	713 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
UAF30	YOR295W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	ORC4	P54791	529 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	VPS72	Q03388	795 aa		4.79	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	HOP1	P20050	605 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	OAR1	P35731	278 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	YHR202W	P38887	602 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	HIS6	P40545	261 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	ADY4	Q05955	493 aa		4.78	□□□□□ -1.64
UAF30	YOR295W	CDC26	P14724	124 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	PTH2	P34222	208 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	YKR075C	P36155	307 aa		4.77	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 274.7 ms