RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	TDA3	P38758	523 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	REV7	P38927	245 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	LYS9	P38999	446 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	RET2	P43621	546 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	COX18	P53239	316 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	RIA1	P53893	1110 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	UME1	Q03010	460 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	MCH5	Q08777	521 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	NUP145	P49687	1317 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	YKR075C	P36155	307 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	FMO1	P38866	432 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	YHR202W	P38887	602 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	NUP60	P39705	539 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	BFA1	P47113	574 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	UBA2	P52488	636 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	SGO1	Q08490	590 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	HIR1	P32479	840 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	GET2	P40056	285 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	TEL2	P53038	688 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	PCL5	P38794	229 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	BEM4	P39011	633 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	YGR153W	P48238	217 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	YGR237C	P50089	785 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	YGL081W	P53156	320 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	YAP1802	P53309	568 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	TMN2	Q04562	672 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	ECM3	Q99252	613 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	SIR3	P06701	978 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	PEX1	P24004	1043 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	SFB3	P38810	929 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	YNL195C	P40168	261 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	SSL2	Q00578	843 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	HFD1	Q04458	532 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YCT1	YLL055W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	GPG1	P53130	126 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	VHS3	Q08438	674 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.02	□□□□□ -1.77	not detected
YCT1	YLL055W	SDS3	P40505	327 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	PET127	P32606	800 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	YKU70	P32807	602 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	UBP12	P39538	1254 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	GND2	P53319	492 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	ECM9	Q02202	377 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	THI22	Q06490	572 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	SWI6	P09959	803 aa		4	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	MTH1	P35198	433 aa		4	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	PHO11	P35842	467 aa		4	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	PHO12	P38693	467 aa		4	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	PIG2	P40187	538 aa		4	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	FHN1	P53279	174 aa		4	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	VPS36	Q06696	566 aa		4	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	IRC10	Q08118	586 aa		4	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	DID4	P36108	232 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	BIT2	P38346	545 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	HXT7	P39004	570 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	STU2	P46675	888 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	YHM2	Q04013	314 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	MLH3	Q12083	715 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	POM34	Q12445	299 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	SEC15	P22224	910 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	PRP28	P23394	588 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	SEC65	P29478	273 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	BCS1	P32839	456 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	SEC6	P32844	805 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	YPT7	P32939	208 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	BIT61	P47041	543 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	YPS7	Q06325	596 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	HFI1	Q12060	488 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	CDC43	P18898	376 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YCT1	YLL055W	KIN82	P25341	720 aa		3.97	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20 ms