RNA–Protein interactions for RNA: YKR085C

MRPL20, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL20, Length 588 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL20	YKR085C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
MRPL20	YKR085C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	PEP12	P32854	288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	SAS3	P34218	831 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	GIP1	P38229	639 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	PPE1	P38796	400 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	TED1	P40533	473 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	VTC2	P43585	828 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	ALT1	P52893	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	AIM33	Q04516	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	OSW2	Q12202	724 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	CLN3	P13365	580 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	SPO11	P23179	398 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	GAC1	P28006	793 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	LEU5	P38702	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	GIP2	P40036	548 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	FYV10	P40492	516 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	STB4	P50104	949 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	YGR266W	P53326	701 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	DIP5	P53388	608 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	EST2	Q06163	884 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	CYC7	P00045	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	STE11	P23561	717 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	RNQ1	P25367	405 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	GPI10	P30777	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	STE5	P32917	917 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	SIS2	P36024	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	VID24	P38263	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	BFA1	P47113	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	SLG1	P54867	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	EEB1	Q02891	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	CSM3	Q04659	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	BI4	P03879	638 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	SFP1	P32432	683 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	TFB1	P32776	642 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	AKR1	P39010	764 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	QDR2	P40474	542 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	FIS1	P40515	155 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	SPC98	P53540	846 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	ADA2	Q02336	434 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	SMA1	Q02651	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	TAF13	P11747	167 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	GSY1	P23337	708 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	VPS3	P23643	1011 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	YER186C	P40101	306 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	IES1	P43579	692 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	DSE4	P53753	1117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	ROD1	Q02805	837 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPL20	YKR085C	COX4	P04037	155 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	PRR1	P28708	518 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	SEA4	P38164	1038 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	MRX3	P38172	270 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	GAA1	P39012	614 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	GDH3	P39708	457 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	BIM1	P40013	344 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	YER158C	P40095	573 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	MFM1	Q02783	413 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	YLH47	Q06493	454 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	RIM20	Q12033	661 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	HRT3	Q12347	344 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	APM4	Q99186	491 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	SRD1	P09007	221 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	DPH2	P32461	534 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	UTH1	P36135	365 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MRPL20	YKR085C	VPS25	P47142	202 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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