RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	RSF1	Q05043	376 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	GAL7	P08431	366 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MIH1	P23748	554 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PAN5	P38787	379 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	TMN3	P40071	706 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	INA22	P40576	216 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	RMD8	P43620	662 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	OAZ1	Q02803	292 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ARR1	Q06596	294 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	LAM4	P38800	1345 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YER152C	P10356	443 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ROX1	P25042	368 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SMC1	P32908	1225 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SUR1	P33300	382 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MRPL40	P36534	297 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SIF2	P38262	535 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	COS111	P38308	924 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	APM2	P38700	605 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	UBP15	P50101	1230 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	TUB4	P53378	473 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	TEP1	P53916	434 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YPL109C	Q02981	657 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YML119W	Q03208	357 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	RSM28	Q03430	361 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YDR338C	Q05497	695 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	CIA1	Q05583	330 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YLR456W	Q06199	204 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PEX15	Q08215	383 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	CDC42	P19073	191 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PMA2	P19657	947 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SFL1	P20134	766 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	AFT1	P22149	690 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ERG3	P32353	365 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	XRS2	P33301	854 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	STV1	P37296	890 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	TAF5	P38129	798 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SEA4	P38164	1038 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YBR225W	P38321	900 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	TCD1	P38756	429 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	HFM1	P51979	1187 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	DSE4	P53753	1117 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ERV41	Q04651	352 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	VPS54	Q12071	889 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	BIK1	P11709	440 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	BUD2	P33314	1104 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PHO11	P35842	467 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MSG5	P38590	489 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PHO12	P38693	467 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	RRM3	P38766	723 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MMM1	P41800	426 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ADI1	Q03677	179 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	RRT8	Q08219	342 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	TFB4	Q12004	338 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ARG3	P05150	338 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	KAP122	P32767	1081 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SLA1	P32790	1244 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	DOM34	P33309	386 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YBR138C	P38277	524 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	LTP1	P40347	161 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	NUT1	P53114	1132 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	TOF1	P53840	1238 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ECM11	Q04110	302 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ECM7	Q06200	448 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	VAC14	Q06708	880 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	CIR2	Q08822	631 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	RTN2	Q12443	393 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	HBN1	Q96VH4	193 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	CDC9	P04819	755 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	NUC1	P08466	329 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ENA1	P13587	1091 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SGF29	P25554	259 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	SRB4	P32569	687 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	PCH2	P38126	564 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	AXL2	P38928	823 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	GIP4	P39732	760 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YEL025C	P39991	1188 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	XKS1	P42826	600 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	GYP8	P43570	497 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ENA2	Q01896	1091 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	MRPL13	Q02204	264 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SET1	YHR119W	YLR345W	Q06137	509 aa		3.49	□□□□□ -1.85

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