RNA–Protein interactions for RNA: YGR212W

SLI1, Transcript of N-acetyltransferase, yeast

Gene SLI1, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLI1	YGR212W	GRX4	P32642	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	ELO3	P40319	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	DAS1	P47005	663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	HLJ1	P48353	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	PUS2	P53167	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	REH1	Q06709	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	MET3	P08536	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	FBP1	P09201	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	CAF16	P43569	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	IMO32	P53219	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	DLT1	Q04216	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	ADY4	Q05955	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	RAD18	P10862	487 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	DAL7	P21826	554 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	PER1	P25625	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	YEL1	P34225	687 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
SLI1	YGR212W	TAD1	P53065	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	HDA1	P53973	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	SWM1	Q12379	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	MCD4	P36051	919 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	YEN1	P40028	759 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	SDP1	P40479	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	TAH11	P47112	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	USO1	P25386	1790 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	PCL2	P25693	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	FLO10	P36170	1169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	PMT3	P47190	753 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	HOF1	Q05080	669 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	COQ11	Q05892	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	THI73	Q07904	523 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	TRM11	Q12463	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	YCL002C	P25565	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	MGS1	P40151	587 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	COG8	Q04632	607 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SLI1	YGR212W	CAT8	P39113	1433 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.84	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	SFL1	P20134	766 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	HOG1	P32485	435 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	ALY2	P47029	1046 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	HXT16	P47185	567 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	YGR237C	P50089	785 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	MET13	P53128	600 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	YAP7	Q08182	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	NUP145	P49687	1317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	SAP190	P36123	1033 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	FKH2	P41813	862 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	MUP1	P50276	574 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	MRPS35	P53292	345 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	UME1	Q03010	460 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	ICT1	Q12385	394 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	DIF1	O13577	133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	PRC1	P00729	532 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
SLI1	YGR212W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	CTF8	P38877	133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	SHR5	P41912	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	ATG33	Q06485	197 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	YAP3	P38749	330 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	PCL5	P38794	229 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	AIM14	P53109	570 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	NHX1	Q04121	633 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	GUD1	Q07729	489 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	HMG1	P12683	1054 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	TOM20	P35180	183 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	RPP1	P38786	293 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	GPG1	P53130	126 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	HAL9	Q12180	1030 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SLI1	YGR212W	YBR053C	P38235	358 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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