RNA–Protein interactions for RNA: YGR006W

PRP18, Transcript of Splicing factor and component of snRNP U5, yeast

Gene PRP18, Length 756 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP18	YGR006W	ELO3	P40319	345 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	MUP1	P50276	574 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	COG6	P53959	839 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	ERG4	P25340	473 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	YCR015C	P25616	317 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	TRM2	P33753	639 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	GIP4	P39732	760 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	NIT2	P47016	307 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	BUL1	P48524	976 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	SKY1	Q03656	742 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	VHS3	Q08438	674 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	PET127	P32606	800 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	BAP3	P41815	604 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	PEX14	P53112	341 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	COX18	P53239	316 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	RNT1	Q02555	471 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	SGO1	Q08490	590 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	YKU70	P32807	602 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	GRX7	P38068	203 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	YBR053C	P38235	358 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	EMP65	P40085	556 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	SPC105	P53148	917 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	FRE5	Q08908	694 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	DAL3	P32459	195 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	BIT2	P38346	545 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	HOS4	P40480	1083 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	SLD3	P53135	668 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	ALG7	P07286	448 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	KAR1	P11927	433 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	PEX1	P24004	1043 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	PLC1	P32383	869 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	FAT1	P38225	669 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	DUN1	P39009	513 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	MTL1	P53214	551 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	PPN1	Q04119	674 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	ADY4	Q05955	493 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	TFC4	P33339	1025 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	SUL1	P38359	859 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	REV7	P38927	245 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	NUP60	P39705	539 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	AIM21	P40563	679 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	YJL163C	P46996	555 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	PEX8	P53248	589 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	YPS7	Q06325	596 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	TRM13	Q12383	476 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
PRP18	YGR006W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	SEC15	P22224	910 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	KIN82	P25341	720 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	BCD1	P38772	366 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	LYS9	P38999	446 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	GET2	P40056	285 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	YNL195C	P40168	261 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	VID28	P40547	921 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	PXA1	P41909	870 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	IES1	P43579	692 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	BIT61	P47041	543 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	UBC11	P52492	156 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	NSE5	Q03718	556 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	VPS36	Q06696	566 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	PEX15	Q08215	383 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	POM34	Q12445	299 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	ECM3	Q99252	613 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRP18	YGR006W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
PRP18	YGR006W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66

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