RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W CDD1Q06549 142 aa9.46□□□□□ -0.9
DDI1YER143W ECM30Q06673 1274 aa9.46□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YPR015CQ12531 247 aa9.46□□□□□ -0.9
DDI1YER143W GAL10P04397 699 aa9.45□□□□□ -0.9
DDI1YER143W EST1P17214 699 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YEL043WP32618 956 aa9.45□□□□□ -0.9
DDI1YER143W BLI1P35727 113 aa9.45□□□□□ -0.9
DDI1YER143W SGM1P47166 707 aa9.45□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YOR022CQ12204 715 aa9.45□□□□□ -0.9
DDI1YER143W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
DDI1YER143W OSH2Q12451 1283 aa9.45□□□□□ -0.9
DDI1YER143W CTF3Q12748 733 aa9.45□□□□□ -0.9
DDI1YER143W BI2P03873 423 aa9.44□□□□□ -0.9
DDI1YER143W BI4P03879 638 aa9.44□□□□□ -0.9
DDI1YER143W CHS1P08004 1131 aa9.44□□□□□ -0.9
DDI1YER143W GFA1P14742 717 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
DDI1YER143W FUB1P25659 250 aa9.44□□□□□ -0.9
DDI1YER143W CYS3P31373 394 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
DDI1YER143W RRN6P32786 894 aa9.44□□□□□ -0.9
DDI1YER143W BUD2P33314 1104 aa9.44□□□□□ -0.9
DDI1YER143W NCL1P38205 684 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
DDI1YER143W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YGR111WP53265 400 aa9.44□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YGR130CP53278 816 aa9.44□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YPR027CQ12079 277 aa9.44□□□□□ -0.9
DDI1YER143W RMP1Q12530 201 aa9.44□□□□□ -0.9
DDI1YER143W BI3Q9ZZW7 517 aa9.44□□□□□ -0.9
DDI1YER143W COX6P00427 148 aa9.43□□□□□ -0.9
DDI1YER143W SDH2P21801 266 aa9.43□□□□□ -0.9
DDI1YER143W AGP2P38090 596 aa9.43□□□□□ -0.9
DDI1YER143W HIS2P38635 335 aa9.43□□□□□ -0.9
DDI1YER143W PSY2P40164 858 aa9.43□□□□□ -0.9
DDI1YER143W ASG1P40467 964 aa9.43□□□□□ -0.9
DDI1YER143W ALT1P52893 592 aa9.43□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YNL115CP53925 644 aa9.43□□□□□ -0.9
DDI1YER143W EEB1Q02891 456 aa9.43□□□□□ -0.9
DDI1YER143W CWC21Q03375 135 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
DDI1YER143W SFI1Q12369 946 aa9.43□□□□□ -0.9
DDI1YER143W NOP14Q99207 810 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YER152CP10356 443 aa9.42□□□□□ -0.9
DDI1YER143W PDR1P12383 1068 aa9.42□□□□□ -0.9
DDI1YER143W RSA4P25382 515 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
DDI1YER143W MRP4P32902 394 aa9.42□□□□□ -0.9
DDI1YER143W BRL1P38770 471 aa9.42□□□□□ -0.9
DDI1YER143W BRO1P48582 844 aa9.42□□□□□ -0.9
DDI1YER143W STB4P50104 949 aa9.42□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YGR035CP53222 116 aa9.42□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YPL034WQ03083 165 aa9.42□□□□□ -0.9
DDI1YER143W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
DDI1YER143W ADE3P07245 946 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
DDI1YER143W TIF1P10081 395 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
DDI1YER143W SAT4P25333 603 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
DDI1YER143W CAP1P28495 268 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
DDI1YER143W BIO2P32451 375 aa9.41□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YMC2P38087 329 aa9.41□□□□□ -0.9
DDI1YER143W POA1P38218 177 aa9.41□□□□□ -0.9
DDI1YER143W RRT2P38332 387 aa9.41□□□□□ -0.9
DDI1YER143W TDA3P38758 523 aa9.41□□□□□ -0.9
DDI1YER143W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
DDI1YER143W CWC22P53333 577 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
DDI1YER143W RRB1Q04225 511 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
DDI1YER143W ERV41Q04651 352 aa9.41□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YLR455WQ06188 304 aa9.41□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YLR462WO13556 202 aa9.4□□□□□ -0.9
DDI1YER143W GCG1P32656 232 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
DDI1YER143W CSE2P33308 149 aa9.4□□□□□ -0.9
DDI1YER143W HEL1P36113 551 aa9.4□□□□□ -0.9
DDI1YER143W PAM1P37304 830 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YHL049CP38722 271 aa9.4□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YEL075CP39972 122 aa9.4□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YER189WP40104 122 aa9.4□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YFL064CP43540 174 aa9.4□□□□□ -0.9
DDI1YER143W ASG7P46993 209 aa9.4□□□□□ -0.9
DDI1YER143W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
DDI1YER143W FMP30Q02883 468 aa9.4□□□□□ -0.9
DDI1YER143W ATG16Q03818 150 aa9.4□□□□□ -0.9
DDI1YER143W SPO21Q12411 609 aa9.4□□□□□ -0.9
DDI1YER143W YBL111CQ3E7Y5 667 aa9.4□□□□□ -0.9
DDI1YER143W TPK1P06244 397 aa9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W VBA3P25594 458 aa9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W EFB1P32471 206 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W BYE1P36106 594 aa9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W VBA5P36172 582 aa9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W GRS1P38088 690 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W SLX1P38324 304 aa9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W SPC72P39723 622 aa9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W ESL1P40456 1118 aa9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W YJR054WP47114 497 aa9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W ALT2P52892 507 aa9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W MND1P53102 219 aa9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W JJJ1P53863 590 aa9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data9.39□□□□□ -0.91not detected
DDI1YER143W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W URH1Q04179 340 aa9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W GYL1Q04322 720 aa9.39□□□□□ -0.91
DDI1YER143W VTI1Q04338 217 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 96.9 ms