RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W SMF1P38925 575 aa11.84□□□□□ -0.51
RNQ1YCL028W SPC72P39723 622 aa11.84□□□□□ -0.51
RNQ1YCL028W BUD16P39988 312 aa11.84□□□□□ -0.51
RNQ1YCL028W CEP3P40969 608 aa11.84□□□□□ -0.51
RNQ1YCL028W YJR054WP47114 497 aa11.84□□□□□ -0.51
RNQ1YCL028W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data11.84□□□□□ -0.51not detected
RNQ1YCL028W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RNQ1YCL028W MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RNQ1YCL028W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RNQ1YCL028W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RNQ1YCL028W CIT2P08679 460 aa11.83□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W DPB3P27344 201 aa11.83□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W HIS2P38635 335 aa11.83□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W MND1P53102 219 aa11.83□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W HOP2P53187 214 aa11.83□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W STP1Q00947 519 aa11.83□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W SKY1Q03656 742 aa11.83□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W VBA3P25594 458 aa11.82□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W VBA5P36172 582 aa11.82□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W XDJ1P39102 459 aa11.82□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W YEL075CP39972 122 aa11.82□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W CWC22P53333 577 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W SDH5Q08230 162 aa11.82□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W SFI1Q12369 946 aa11.82□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W JIP3O13555 125 aa11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W STE11P23561 717 aa11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W PAP1P29468 568 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W BIO2P32451 375 aa11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W YEL043WP32618 956 aa11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W KDX1P36005 433 aa11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W MRPL7P36519 292 aa11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W YMC2P38087 329 aa11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W RRT2P38332 387 aa11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W QNS1P38795 714 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W POL31P46957 487 aa11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W SPC98P53540 846 aa11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W MUB1Q03162 620 aa11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W GYL1Q04322 720 aa11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W TRE1Q08919 783 aa11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W NOP14Q99207 810 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W BI2P03873 423 aa11.8□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W BI4P03879 638 aa11.8□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W MSD1P15179 658 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W ADK2P26364 225 aa11.8□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W DBF4P32325 704 aa11.8□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W FRE1P32791 686 aa11.8□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W BYE1P36106 594 aa11.8□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W RCK2P38623 610 aa11.8□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W BRO1P48582 844 aa11.8□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W ATG16Q03818 150 aa11.8□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W POB3Q04636 552 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W ERV41Q04651 352 aa11.8□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W BI3Q9ZZW7 517 aa11.8□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W YLR462WO13556 202 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W GAL80P04387 435 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W HAP2P06774 265 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W KAR3P17119 729 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W SAT4P25333 603 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W CCL1P37366 393 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W APN2P38207 520 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W SHE3P38272 425 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W YHL049CP38722 271 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W YHR202WP38887 602 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W DSE1P40077 573 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W YER189WP40104 122 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W SIP5P40210 489 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W OPT1P40897 799 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W YFL064CP43540 174 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W PUS2P53167 370 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W MAL13P53338 473 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W ARO80Q04052 950 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data11.79□□□□□ -0.52not detected
RNQ1YCL028W ZRT2Q12436 422 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W YBL111CQ3E7Y5 667 aa11.79□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W LRE1P25579 583 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W GAC1P28006 793 aa11.78□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W RPT2P40327 437 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W RRB1Q04225 511 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
RNQ1YCL028W ABD1P32783 436 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W SEG2P34250 1132 aa11.77□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W YBL036CP38197 257 aa11.77□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W ASG1P40467 964 aa11.77□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W MAD1P40957 749 aa11.77□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W SNZ3P43545 298 aa11.77□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W ASG7P46993 209 aa11.77□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W SNZ2P53824 298 aa11.77□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W YDR278CQ05612 105 aa11.77□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W EMP46Q12396 444 aa11.77□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W SPO21Q12411 609 aa11.77□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W TPK1P06244 397 aa11.76□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W HIP1P06775 603 aa11.76□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W ADE3P07245 946 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W MRP4P32902 394 aa11.76□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W SLA2P33338 968 aa11.76□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W JHD1P40034 492 aa11.76□□□□□ -0.53
RNQ1YCL028W TMN3P40071 706 aa11.76□□□□□ -0.53
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