RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023054.13

Apobec3-201, Transcript of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Apobec3, Length 1,842 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tcf3P15806 651 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-201ENSMUST00000023054 GabrdP22933 449 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sptlc3Q8BG54 563 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cep57l1Q8VDS7 400 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Stx6Q9JKK1 255 aa11.09□□□□□ -0.63
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Prl7a2O54831 253 aa11.08□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 ErmnQ5EBJ4 281 aa11.08□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm21985Q6P6P5 1106 aa11.08□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Map10Q8BJS7 891 aa11.08□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sp8Q8BMJ8 486 aa11.08□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tmem67Q8BR76 992 aa11.08□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Lmbrd2Q8C561 694 aa11.08□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Iffo2Q8R2V2 512 aa11.08□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Izumo3A6PWV3 263 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cyp2d10P24456 504 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Stat1P42225 749 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slc7a3P70423 618 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 VeztQ3ZK22 780 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ankrd13dQ6PD24 605 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Taok2Q6ZQ29 1240 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Atad2Q8CDM1 1040 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pus3Q9JI38 481 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Aox1O54754 1333 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Myo3bQ1EG27 1305 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 FanccP50652 591 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 GalcP54818 684 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ncaph2Q8BSP2 607 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Alx1Q8C8B0 326 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Amhr2Q8K592 568 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gripap1Q8VD04 806 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 BrapQ99MP8 591 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Bloc1s2Q9CWG9 143 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 DmtnQ9WV69 405 aa11.07□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa11.06□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Eef2kO08796 724 aa11.06□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 F2rP30558 430 aa11.06□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 ParvgQ9ERD8 331 aa11.06□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 IncenpQ9WU62 880 aa11.06□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mroh6V9GX81 722 aa11.06□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Greb1lB9EJV3 1913 aa11.06□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Spryd3E9Q9B3 442 aa11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Usp48Q3V0C5 1052 aa11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Spty2d1Q68FG3 682 aa11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Mast3Q3U214 1321 aa11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Col3a1P08121 1464 aa11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gnat2P50149 354 aa11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rps8P62242 208 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Sik3Q6P4S6 1311 aa11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ubn2Q80WC1 1314 aa11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tceanc2Q8R2M0 207 aa11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Rufy2Q8R4C2 606 aa11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dbndd1Q9CZ00 160 aa11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Odf2lQ9D478 642 aa11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gja10Q9WUS4 505 aa11.05□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 CrcpO35427 148 aa11.04□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Il15P48346 162 aa11.04□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Limch1Q3UH68 1057 aa11.04□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Washc4Q3UMB9 1173 aa11.04□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cpa2Q504N0 417 aa11.04□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Tmx3Q8BXZ1 456 aa11.04□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pms1Q8K119 917 aa11.04□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Naa16Q9DBB4 864 aa11.04□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 FliiQ9JJ28 1271 aa11.04□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Wdr93Q402B2 695 aa11.03□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Znf496Q5SXI5 585 aa11.03□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 R3hcc1Q8BSI6 488 aa11.03□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cep55Q8BT07 462 aa11.03□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Olfm5Q8BU90 496 aa11.03□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Slc39a11Q8BWY7 342 aa11.03□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Krt84Q99M73 603 aa11.03□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Dydc2Q9D3X8 139 aa11.03□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Ltbp1Q8CG19 1712 aa11.03□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa11.03□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 A0A1W2P7S8 802 aa11.02□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Gm7347D3YYI9 267 aa11.02□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 TrdnE9Q9K5 693 aa11.02□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Speer4aF8VPX6 267 aa11.02□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pald1P70261 859 aa11.02□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 IntuQ059U7 942 aa11.02□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Pla2g4fQ50L41 855 aa11.02□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Cdc5lQ6A068 802 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Edrf1Q6GQV7 1239 aa11.02□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
Apobec3-201ENSMUST00000023054 Nap1l3Q794H2 544 aa11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10 ms