Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD8

Parvg, Gamma-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvgQ9ERD8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
ParvgQ9ERD8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
ParvgQ9ERD8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ParvgQ9ERD8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
ParvgQ9ERD8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
ParvgQ9ERD8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ParvgQ9ERD8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
ParvgQ9ERD8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
ParvgQ9ERD8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
ParvgQ9ERD8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
ParvgQ9ERD8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
ParvgQ9ERD8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
ParvgQ9ERD8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ParvgQ9ERD8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ParvgQ9ERD8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ParvgQ9ERD8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
ParvgQ9ERD8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
ParvgQ9ERD8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
ParvgQ9ERD8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ParvgQ9ERD8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ParvgQ9ERD8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
ParvgQ9ERD8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
ParvgQ9ERD8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ParvgQ9ERD8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
ParvgQ9ERD8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ParvgQ9ERD8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ParvgQ9ERD8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ParvgQ9ERD8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ParvgQ9ERD8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ParvgQ9ERD8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ParvgQ9ERD8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ParvgQ9ERD8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
ParvgQ9ERD8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
ParvgQ9ERD8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ParvgQ9ERD8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
ParvgQ9ERD8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ParvgQ9ERD8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ParvgQ9ERD8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ParvgQ9ERD8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ParvgQ9ERD8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ParvgQ9ERD8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ParvgQ9ERD8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ParvgQ9ERD8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ParvgQ9ERD8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ParvgQ9ERD8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ParvgQ9ERD8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
ParvgQ9ERD8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ParvgQ9ERD8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ParvgQ9ERD8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ParvgQ9ERD8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ParvgQ9ERD8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ParvgQ9ERD8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ParvgQ9ERD8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ParvgQ9ERD8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ParvgQ9ERD8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
ParvgQ9ERD8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ParvgQ9ERD8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ParvgQ9ERD8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ParvgQ9ERD8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ParvgQ9ERD8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
ParvgQ9ERD8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ParvgQ9ERD8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ParvgQ9ERD8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ParvgQ9ERD8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ParvgQ9ERD8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ParvgQ9ERD8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ParvgQ9ERD8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ParvgQ9ERD8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ParvgQ9ERD8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ParvgQ9ERD8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
ParvgQ9ERD8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ParvgQ9ERD8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ParvgQ9ERD8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ParvgQ9ERD8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ParvgQ9ERD8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
ParvgQ9ERD8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ParvgQ9ERD8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ParvgQ9ERD8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ParvgQ9ERD8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ParvgQ9ERD8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
ParvgQ9ERD8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ParvgQ9ERD8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ParvgQ9ERD8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ParvgQ9ERD8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ParvgQ9ERD8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
ParvgQ9ERD8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ParvgQ9ERD8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ParvgQ9ERD8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ParvgQ9ERD8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ParvgQ9ERD8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ParvgQ9ERD8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ParvgQ9ERD8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ParvgQ9ERD8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ParvgQ9ERD8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ParvgQ9ERD8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ParvgQ9ERD8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ParvgQ9ERD8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ParvgQ9ERD8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ParvgQ9ERD8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ParvgQ9ERD8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms