RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA RET2P43621 546 aa3.85□□□□□ -1.79
15S_rRNA15S_rRNA YJR096WP47137 282 aa3.85□□□□□ -1.79
15S_rRNA15S_rRNA DCS2Q12123 353 aa3.85□□□□□ -1.79
15S_rRNA15S_rRNA NUP145P49687 1317 aa3.85□□□□□ -1.79
15S_rRNA15S_rRNA SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.84□□□□□ -1.79not detected
15S_rRNA15S_rRNA TYS1P36421 394 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
15S_rRNA15S_rRNA APN2P38207 520 aa3.84□□□□□ -1.79
15S_rRNA15S_rRNA YHR112CP38716 378 aa3.84□□□□□ -1.79
15S_rRNA15S_rRNA SET2P46995 733 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
15S_rRNA15S_rRNA GPD1Q00055 391 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
15S_rRNA15S_rRNA CTK1Q03957 528 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
15S_rRNA15S_rRNA HMO1Q03973 246 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
15S_rRNA15S_rRNA NDJ1Q12366 352 aa3.84□□□□□ -1.79
15S_rRNA15S_rRNA PRP19P32523 503 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA TDP1P38319 544 aa3.84□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA TDA3P38758 523 aa3.84□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA HOS4P40480 1083 aa3.84□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA BFA1P47113 574 aa3.84□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA YGR237CP50089 785 aa3.84□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA BRE5P53741 515 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA YKR075CP36155 307 aa3.83□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA AKL1P38080 1108 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA CCT3P39077 534 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA UBP12P39538 1254 aa3.83□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA GZF3P42944 551 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA HFD1Q04458 532 aa3.83□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA BNR1P40450 1375 aa3.83□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA PYC1P11154 1178 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA BCD1P38772 366 aa3.82□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA BEM4P39011 633 aa3.82□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA CCT5P40413 562 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA YGR153WP48238 217 aa3.82□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA UBC11P52492 156 aa3.82□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA GPG1P53130 126 aa3.82□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA LEE1Q02799 301 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA RNR1P21524 888 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA REV7P38927 245 aa3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA FMP52P40008 231 aa3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA TAH11P47112 604 aa3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA VPS73P53142 486 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA RIA1P53893 1110 aa3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA HRP1Q99383 534 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA HIS7P33734 552 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA YHR202WP38887 602 aa3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA LYS9P38999 446 aa3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA NUP60P39705 539 aa3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA NUG1P40010 520 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA MTL1P53214 551 aa3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA YAP1802P53309 568 aa3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA SGO1Q08490 590 aa3.81□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA SIR3P06701 978 aa3.8□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA GRX4P32642 244 aa3.8□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA DID4P36108 232 aa3.8□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA FLO10P36170 1169 aa3.8□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA FMO1P38866 432 aa3.8□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA GPP1P41277 250 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA MNN11P46985 422 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA ECM9Q02202 377 aa3.8□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA SWI6P09959 803 aa3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA GFA1P14742 717 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA MDM10P18409 493 aa3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA PEX1P24004 1043 aa3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA ERG6P25087 383 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA PPZ2P33329 710 aa3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA GET2P40056 285 aa3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA NOP9P47077 666 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA TEL2P53038 688 aa3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA COX18P53239 316 aa3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA YMR210WQ03649 449 aa3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA VHS3Q08438 674 aa3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA YKL033W-AQ86ZR7 236 aa3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA APM4Q99186 491 aa3.79□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA ERG20P08524 352 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA KIN3P22209 435 aa3.78□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA MVD1P32377 396 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA HIR1P32479 840 aa3.78□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA PET127P32606 800 aa3.78□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA RIX1P38883 763 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA YEN1P40028 759 aa3.78□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA RSC8P43609 557 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA YLR407WQ06070 228 aa3.78□□□□□ -1.8
15S_rRNA15S_rRNA IMG2P25642 146 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
15S_rRNA15S_rRNA YKU70P32807 602 aa3.77□□□□□ -1.81
15S_rRNA15S_rRNA CBR1P38626 284 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
15S_rRNA15S_rRNA HXT6P39003 570 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
15S_rRNA15S_rRNA HXT7P39004 570 aa3.77□□□□□ -1.81
15S_rRNA15S_rRNA PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
15S_rRNA15S_rRNA SSL2Q00578 843 aa3.77□□□□□ -1.81
15S_rRNA15S_rRNA HFI1Q12060 488 aa3.77□□□□□ -1.81
15S_rRNA15S_rRNA FRS1P15624 595 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
15S_rRNA15S_rRNA TSR4P25040 408 aa3.77□□□□□ -1.81
15S_rRNA15S_rRNA YPT7P32939 208 aa3.77□□□□□ -1.81
15S_rRNA15S_rRNA OAF3P36023 863 aa3.77□□□□□ -1.81
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