RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 HOXC12P31275 282 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 OCLNQ16625 522 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 NXNL2Q5VZ03 156 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 DNM1P34Q6PK57 102 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 BEND4Q6ZU67 534 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 OR6V1Q8N148 313 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ZNF610Q8N9Z0 462 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 OR2T4Q8NH00 348 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 UBE2FQ969M7 185 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 B9D1Q9UPM9 204 aa14.77□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 FAM183AA6NL82 134 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 DENRO43583 198 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 SLC16A7O60669 478 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 IGHV3-9P01782 118 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 MPGP29372 298 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 CENPAP49450 140 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 P2RY6Q15077 328 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 NRN1LQ496H8 165 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 SLC35D3Q5M8T2 416 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 LINC01590Q5TEZ4 76 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 APH1BQ8WW43 257 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 TSSK2Q96PF2 358 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 MED20Q9H944 212 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 CRLF2Q9HC73 371 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 UPB1Q9UBR1 384 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 MOKQ9UQ07 419 aa14.76□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ITGA5P08648 1049 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 GAAP10253 952 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 DNASE1P24855 282 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 PCSK6P29122 969 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 FAPQ12884 760 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 CEACAM16Q2WEN9 425 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 GID4Q8IVV7 300 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 BBS1Q8NFJ9 593 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 MARCH7Q9H992 704 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 RASSF1Q9NS23 344 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 LRRC42Q9Y546 428 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ANK2Q01484 3957 aa14.75□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 CCDC182A6NF36 153 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 KRT33AO76009 404 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 GLCEO94923 617 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 CLUP10909 449 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 IGHV1-2P23083 117 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ASCL1P50553 236 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ZNF84P51523 738 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 BLVRAP53004 296 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 IL5RAQ01344 420 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 TMED1Q13445 227 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 KCNMB1Q16558 191 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 CDC20BQ86Y33 519 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 NABP1Q96AH0 204 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 Q9H521 79 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.74□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ENTPD6O75354 484 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ATE1O95260 518 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 HRGP04196 525 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 GYPBP06028 91 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 LAP3P28838 519 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 PYCR1P32322 319 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 GLO1Q04760 184 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 GGTLC2Q14390 218 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 ETFDHQ16134 617 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.73□□□□□ -0.05
PACS1-208ENST00000529677 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6 ms