RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C VPS73P53142 486 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C MDM12Q92328 271 aa2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C HCA4P20448 770 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C MIH1P23748 554 aa2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C UBS1P38290 277 aa2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C PCL5P38794 229 aa2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C LYS9P38999 446 aa2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C GID8P40208 455 aa2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C TAH11P47112 604 aa2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C BNA2P47125 453 aa2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C SMX3P54999 86 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C HMO1Q03973 246 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C TAF3Q12297 353 aa2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C YOR131CQ12486 218 aa2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C YNL162W-AQ3E7A8 72 aa2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C YLR149CQ99296 730 aa2.58□□□□□ -2
HDA3YPR179C TUB1P09733 447 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C ERR1P0CX10 437 aa2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C ERR2P0CX11 437 aa2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C CDC43P18898 376 aa2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C ADE2P21264 571 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C PER1P25625 357 aa2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C APL2P36000 726 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C TDP1P38319 544 aa2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C MIP6P38760 659 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C CAF16P43569 289 aa2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C ALY2P47029 1046 aa2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C MTR3P48240 250 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C YAP1802P53309 568 aa2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C ARG5,6Q01217 863 aa2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C CRR1Q05790 422 aa2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
HDA3YPR179C PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data2.56□□□□□ -2not detected
HDA3YPR179C YHR112CP38716 378 aa2.56□□□□□ -2
HDA3YPR179C CCT3P39077 534 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
HDA3YPR179C YIL166CP40445 542 aa2.56□□□□□ -2
HDA3YPR179C SHR5P41912 237 aa2.56□□□□□ -2
HDA3YPR179C CCT7P42943 550 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
HDA3YPR179C IMO32P53219 342 aa2.56□□□□□ -2
HDA3YPR179C SSL2Q00578 843 aa2.56□□□□□ -2
HDA3YPR179C CIT2P08679 460 aa2.56□□□□□ -2
HDA3YPR179C RIX1P38883 763 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
HDA3YPR179C PRP31P49704 494 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
HDA3YPR179C GAD1Q04792 585 aa2.56□□□□□ -2
HDA3YPR179C HOF1Q05080 669 aa2.56□□□□□ -2
HDA3YPR179C MCM21Q06675 368 aa2.56□□□□□ -2
HDA3YPR179C BNR1P40450 1375 aa2.56□□□□□ -2
HDA3YPR179C PYC1P11154 1178 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
HDA3YPR179C KIN3P22209 435 aa2.55□□□□□ -2
HDA3YPR179C PPZ2P33329 710 aa2.55□□□□□ -2
HDA3YPR179C STO1P34160 861 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
HDA3YPR179C FMO1P38866 432 aa2.55□□□□□ -2
HDA3YPR179C MTL1P53214 551 aa2.55□□□□□ -2
HDA3YPR179C FHN1P53279 174 aa2.55□□□□□ -2
HDA3YPR179C SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
HDA3YPR179C ARO10Q06408 635 aa2.55□□□□□ -2
HDA3YPR179C AIM44Q99299 758 aa2.55□□□□□ -2
HDA3YPR179C HRP1Q99383 534 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
HDA3YPR179C CDC9P04819 755 aa2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C DMC1P25453 334 aa2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C HIS7P33734 552 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C FLO10P36170 1169 aa2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data2.54□□□□□ -2not detected
HDA3YPR179C REV7P38927 245 aa2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C NUP60P39705 539 aa2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C OSW7P43611 510 aa2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C YKL033W-AQ86ZR7 236 aa2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C MEF1P25039 761 aa2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C ERG6P25087 383 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C TIM23P32897 222 aa2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C YKR018CP36114 725 aa2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C NUP82P40368 713 aa2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C YBP2P53169 641 aa2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C RNH70P53331 553 aa2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C Q0142Q9ZZW4 58 aa2.54□□□□□ -2
HDA3YPR179C MET6P05694 767 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
HDA3YPR179C ADY2P25613 283 aa2.53□□□□□ -2
HDA3YPR179C EMP70P32802 667 aa2.53□□□□□ -2
HDA3YPR179C GET2P40056 285 aa2.53□□□□□ -2
HDA3YPR179C NDC80P40460 691 aa2.53□□□□□ -2
HDA3YPR179C CTK1Q03957 528 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
HDA3YPR179C MSH2P25847 964 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C HOG1P32485 435 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C PEX2P32800 271 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C PPG1P32838 368 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C SEC6P32844 805 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C YKR051WP36142 418 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C YJL206CP39529 758 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C ORC4P54791 529 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C ARP4P80428 489 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C MLH3Q12083 715 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C SRD1P09007 221 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C PEX1P24004 1043 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C YEL1P34225 687 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C PHO11P35842 467 aa2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C CBR1P38626 284 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
HDA3YPR179C PHO12P38693 467 aa2.52□□□□□ -2.01
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