RNA–Protein interactions for RNA: YOR087W

YVC1, Transcript of Vacuolar cation channel, yeast

Gene YVC1, Length 2,028 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YVC1	YOR087W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	MSS18	P08593	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	FBP1	P09201	348 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	DBF20	P32328	564 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	QRI7	P43122	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	COQ2	P32378	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	ATG19	P35193	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	BEM4	P39011	633 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	YFL066C	P43538	392 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	ARP4	P80428	489 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	THI72	Q08579	599 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	HOP1	P20050	605 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	CTF8	P38877	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	PHM7	Q12252	991 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	CHS2	P14180	963 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	ADP1	P25371	1049 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	SSY5	P47002	699 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	YML131W	Q03102	365 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	SSY1	Q03770	852 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	SPE1	P08432	466 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	ATP12	P22135	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	RPN12	P32496	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	TAT1	P38085	619 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	SAW1	P39735	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	TAF1	P46677	1066 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	ASK10	P48361	1146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	NFU1	P32860	256 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	YHR078W	P38799	552 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	SDP1	P40479	209 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	HOS4	P40480	1083 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	VID28	P40547	921 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	MND2	P40577	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	ORC4	P54791	529 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	ENT2	Q05785	613 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	CMP2	P14747	604 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	MSM1	P22438	575 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	SDS22	P36047	338 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	YIL092W	P40497	633 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	NSG2	P53898	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	TEP1	P53916	434 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	HLR1	Q04429	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	OMS1	Q06668	471 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
YVC1	YOR087W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YVC1	YOR087W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	PHO3	P24031	467 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	APN2	P38207	520 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	YHR202W	P38887	602 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	IML2	P47031	731 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	NUR1	Q12066	484 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	ARP7	Q12406	477 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	CDC26	P14724	124 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	MSH1	P25846	959 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	STL1	P39932	569 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	PZF1	P39933	429 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	PSF3	Q12146	194 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	RRI2	Q12348	645 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	DGR2	P32330	852 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	HXT4	P32467	576 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	SAK1	P38990	1142 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	IES1	P43579	692 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	IRC5	P43610	853 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	HIM1	Q06674	414 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.5	□□□□□ -1.69	not detected
YVC1	YOR087W	KAE1	P36132	386 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YVC1	YOR087W	DUN1	P39009	513 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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