RNA–Protein interactions for RNA: YOL007C

CSI2, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene CSI2, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI2	YOL007C	SEC5	P89102	971 aa		4.31	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.31	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.31	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	ORC2	P32833	620 aa		4.3	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	GLG1	P36143	616 aa		4.3	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	SFB3	P38810	929 aa		4.3	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	BDH2	P39713	417 aa		4.3	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	MTL1	P53214	551 aa		4.3	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	REH1	Q06709	432 aa		4.3	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	RPN13	O13563	156 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	OCA5	P38738	679 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	FMO1	P38866	432 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	ARG2	P40360	574 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	SHR5	P41912	237 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	CTR1	P49573	406 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.28	□□□□□ -1.72	not detected
CSI2	YOL007C	LYS9	P38999	446 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	ECM1	P39715	212 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	YJL049W	P47048	450 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	HXT16	P47185	567 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CSI2	YOL007C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	RAD4	P14736	754 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	TAF8	Q03750	510 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	RIM13	Q03792	727 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	MET7	Q08645	548 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	DIF1	O13577	133 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	CIT1	P00890	479 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	ALG2	P43636	503 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	FHN1	P53279	174 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	OSW1	Q08692	278 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	YTA7	P40340	1379 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	VPS34	P22543	875 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	PHO11	P35842	467 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	PHO12	P38693	467 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	YHR112C	P38716	378 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	NUP60	P39705	539 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	PAC2	P39937	518 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	YBP2	P53169	641 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	ATG4	P53867	494 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	ATP25	Q03153	612 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	MLH3	Q12083	715 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	PER1	P25625	357 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	BET3	P36149	193 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.23	□□□□□ -1.73	not detected
CSI2	YOL007C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	GAT1	P43574	510 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	SEG1	Q04279	960 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	SPC29	P33419	253 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	HUL4	P40985	892 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	TIM54	P47045	478 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSI2	YOL007C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	MUP3	P38734	546 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	ALY2	P47029	1046 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	MRK1	P50873	501 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	USV1	Q12132	391 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.2	□□□□□ -1.74	not detected
CSI2	YOL007C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	RTA1	P53047	317 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	FUB1	P25659	250 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	SET3	P36124	751 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	NSE3	Q05541	303 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	ERG11	P10614	530 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	GET2	P40056	285 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	OSW7	P43611	510 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	MCM21	Q06675	368 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	FLC1	Q08967	793 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	PTP1	P25044	335 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	SCS3	P53012	380 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	ORC4	P54791	529 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	RPN4	Q03465	531 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CSI2	YOL007C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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