RNA–Protein interactions for RNA: YMR250W

GAD1, Transcript of Glutamate decarboxylase, yeast

Gene GAD1, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GAD1	YMR250W	SHE10	P53075	577 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	TBF1	Q02457	562 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	MTF2	P10849	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	SWI3	P32591	825 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	JNM1	P36224	373 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	AIM21	P40563	679 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	LAM5	P43560	674 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	SMC3	P47037	1230 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YNL115C	P53925	644 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ERG5	P54781	538 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ECM7	Q06200	448 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	TUP1	P16649	713 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	GLN3	P18494	730 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
GAD1	YMR250W	SPC110	P32380	944 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	CDC11	P32458	415 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	TRM2	P33753	639 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	PCH2	P38126	564 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	FTR1	P40088	404 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	FIG4	P42837	879 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	TAD1	P53065	400 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
GAD1	YMR250W	MUK1	Q02866	612 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	VPS38	Q05919	439 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	PLP2	Q12017	286 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YDL206W	Q12424	762 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	COX4	P04037	155 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	IME1	P21190	360 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	PXL1	P36166	706 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	MRX3	P38172	270 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	MMM1	P41800	426 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	CPR7	P47103	393 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	GCV2	P49095	1034 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	AGE1	Q04412	482 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ESC2	Q06340	456 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	OPY2	Q06810	360 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	PET123	P17558	318 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	RRT12	P25381	491 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	FUB1	P25659	250 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	PRR1	P28708	518 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	SEC9	P40357	651 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	SDS3	P40505	327 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ALT2	P52892	507 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	PCD1	Q12524	340 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	DAL2	P25335	343 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	KIP1	P28742	1111 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	CSE2	P33308	149 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
GAD1	YMR250W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	TUB4	P53378	473 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ESBP6	P53918	673 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	RAD57	P25301	460 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	HEL1	P36113	551 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	CAJ1	P39101	391 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YER186C	P40101	306 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	ALF1	P53904	254 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	CTR9	P89105	1077 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GAD1	YMR250W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13 ms