RNA–Protein interactions for RNA: YMR039C

SUB1, Transcript of Transcriptional coactivator, yeast

Gene SUB1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SUB1	YMR039C	MSH2	P25847	964 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	SPC42	P36094	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	BCD1	P38772	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	FMP52	P40008	231 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	YFL052W	P43551	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	OSW7	P43611	510 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	UGO1	Q03327	502 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	GAD1	Q04792	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	SGO1	Q08490	590 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	CIT2	P08679	460 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	MEF1	P25039	761 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	VBA3	P25594	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	DSS1	P39112	969 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	UBC11	P52492	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	NPY1	P53164	384 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	PCL5	P38794	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	TEL2	P53038	688 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	ORC4	P54791	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	NHX1	Q04121	633 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	YTA7	P40340	1379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	SRD1	P09007	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	MIH1	P23748	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	THI4	P32318	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	HOG1	P32485	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	PEX6	P33760	1030 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	HSL7	P38274	827 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	YHR112C	P38716	378 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	SSL2	Q00578	843 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
SUB1	YMR039C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	SIR3	P06701	978 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	HIR1	P32479	840 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	YPT53	P36019	220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	YKR018C	P36114	725 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	YKR051W	P36142	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	APT2	P36973	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	YAP1802	P53309	568 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	COG8	Q04632	607 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	MCM21	Q06675	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	YEL1	P34225	687 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	REV7	P38927	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SUB1	YMR039C	GID8	P40208	455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	PCL10	P53124	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	MTL1	P53214	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	FMO1	P38866	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	LYS9	P38999	446 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	NUP60	P39705	539 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	CDC43	P18898	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	PCL2	P25693	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	REC102	Q02721	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	NTG2	Q08214	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	RAD18	P10862	487 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	KIN3	P22209	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	ATG33	Q06485	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	SUT2	Q12286	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	TDP1	P38319	544 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	ATF1	P40353	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	FHN1	P53279	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	ARP4	P80428	489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	HMG1	P12683	1054 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	DMC1	P25453	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	SFB3	P38810	929 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	NDC80	P40460	691 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	TAH11	P47112	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	TAF3	Q12297	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	SFL1	P20134	766 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	PEX1	P24004	1043 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SUB1	YMR039C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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