RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W ARP4P80428 489 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W YLR122CQ12312 125 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data5.55□□□□□ -1.52not detected
YKR047WYKR047W SPE1P08432 466 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W FBP1P09201 348 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W APA1P16550 321 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W MND2P40577 368 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W MTR3P48240 250 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W HOL1P53389 586 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W CNM67P53865 581 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W SVL3Q03088 825 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W YPR053CQ6Q5F3 151 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W SWI6P09959 803 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W PHO81P17442 1178 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W ATP12P22135 325 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W KAE1P36132 386 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W MIP6P38760 659 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W YHR078WP38799 552 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W CTF8P38877 133 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W SDP1P40479 209 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W BRE5P53741 515 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W YPL034WQ03083 165 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W PSR2Q07949 397 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR047WYKR047W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W GAL10P04397 699 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W DBF20P32328 564 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W ATG19P35193 415 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W SAK1P38990 1142 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W BEM4P39011 633 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W VID27P40157 782 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W QRI7P43122 407 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W YGR130CP53278 816 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W ORC4P54791 529 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W LEE1Q02799 301 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W MCA1Q08601 432 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W YOL114CQ12322 202 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W LPX1Q12405 387 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W MSS18P08593 268 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W GLN4P13188 809 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W EXO84P38261 753 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W YHR202WP38887 602 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W PZF1P39933 429 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W ACA1P39970 489 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W VID28P40547 921 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W SAP185P40856 1058 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W NOP15P53927 220 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W YLR407WQ06070 228 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W OMS1Q06668 471 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W WHI4Q07655 649 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W CYC7P00045 113 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W SSH4P32343 579 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W AKL1P38080 1108 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W APN2P38207 520 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W ERP2P39704 215 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W YIL092WP40497 633 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W ASK10P48361 1146 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W YMR210WQ03649 449 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W ASM4Q05166 528 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W TPO1Q07824 586 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W NUR1Q12066 484 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W SED4P25365 1065 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W HXT4P32467 576 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W DUN1P39009 513 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W SAW1P39735 261 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W EAF5P39995 279 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W SET2P46995 733 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W HIM1Q06674 414 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W CDC26P14724 124 aa5.48□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W HOP1P20050 605 aa5.48□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W PHO3P24031 467 aa5.48□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W DGR2P32330 852 aa5.48□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W SKN7P38889 622 aa5.48□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W VPS27P40343 622 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W PFA3P42836 336 aa5.48□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W YBP2P53169 641 aa5.48□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W YML131WQ03102 365 aa5.48□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W ADY3Q07732 790 aa5.48□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W UPC2Q12151 913 aa5.48□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W SEC18P18759 758 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W MSH1P25846 959 aa5.47□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W PET309P32522 965 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W SRP68P38687 599 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W TEP1P53916 434 aa5.47□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W COG4Q06096 861 aa5.47□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W GPR1Q12361 961 aa5.47□□□□□ -1.53
YKR047WYKR047W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W SDS22P36047 338 aa5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W ETP1P38748 585 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
YKR047WYKR047W STL1P39932 569 aa5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 88.6 ms