RNA–Protein interactions for RNA: YKL086W

SRX1, Transcript of Sulfiredoxin, yeast

Gene SRX1, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRX1	YKL086W	KIP1	P28742	1111 aa		18.6	■□□□□ 0.57
SRX1	YKL086W	NIP100	P33420	868 aa		18.6	■□□□□ 0.57
SRX1	YKL086W	HMT1	P38074	348 aa		18.6	■□□□□ 0.57
SRX1	YKL086W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	18.6	■□□□□ 0.57
SRX1	YKL086W	POL31	P46957	487 aa		18.6	■□□□□ 0.57
SRX1	YKL086W	PLP2	Q12017	286 aa		18.6	■□□□□ 0.57
SRX1	YKL086W	SYN8	P31377	255 aa		18.59	■□□□□ 0.57
SRX1	YKL086W	APM2	P38700	605 aa		18.59	■□□□□ 0.57
SRX1	YKL086W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
SRX1	YKL086W	NUT1	P53114	1132 aa		18.59	■□□□□ 0.57
SRX1	YKL086W	YPR027C	Q12079	277 aa		18.59	■□□□□ 0.57
SRX1	YKL086W	MNL2	Q12205	849 aa		18.59	■□□□□ 0.57
SRX1	YKL086W	CDC11	P32458	415 aa		18.58	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	18.58	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	PEX2	P32800	271 aa		18.58	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	AGP2	P38090	596 aa		18.58	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	STB5	P38699	743 aa		18.58	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	PPM1	Q04081	328 aa		18.58	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	18.57	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	YIR016W	P40572	265 aa		18.57	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	SMC1	P32908	1225 aa		18.56	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	MIC60	P36112	540 aa		18.56	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	SDS3	P40505	327 aa		18.56	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	HFM1	P51979	1187 aa		18.56	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	YLR287C	Q05881	355 aa		18.56	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	YPR078C	Q06813	372 aa		18.56	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	CHS1	P08004	1131 aa		18.55	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	CCC2	P38995	1004 aa		18.55	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	DAL2	P25335	343 aa		18.54	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	GEM1	P39722	662 aa		18.54	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	VPS75	P53853	264 aa		18.54	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	ECM3	Q99252	613 aa		18.54	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		18.54	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	RAD27	P26793	382 aa		18.53	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	YJR054W	P47114	497 aa		18.53	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	ESBP6	P53918	673 aa		18.53	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	MAS1	P10507	462 aa		18.52	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	PHO13	P19881	312 aa		18.52	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	SCJ1	P25303	377 aa		18.52	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	SLA2	P33338	968 aa		18.52	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	CSG2	P35206	410 aa		18.52	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	KDX1	P36005	433 aa		18.52	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	VFA1	P40080	203 aa		18.52	■□□□□ 0.56
SRX1	YKL086W	TPK1	P06244	397 aa		18.51	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	RTT107	P38850	1070 aa		18.51	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	MAF1	P41910	395 aa		18.51	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	MUB1	Q03162	620 aa		18.51	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	TAF10	Q12030	206 aa		18.51	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	FRE1	P32791	686 aa		18.5	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	YBR284W	P38150	797 aa		18.5	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	RGD1	P38339	666 aa		18.5	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	ADA2	Q02336	434 aa		18.5	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	UME1	Q03010	460 aa		18.5	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	PIG1	Q06216	648 aa		18.5	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	PGS1	P25578	521 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	GAC1	P28006	793 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	YHR131C	P38835	850 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	APM4	Q99186	491 aa		18.49	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	TUP1	P16649	713 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	ZAP1	P47043	880 aa		18.48	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	DYS1	P38791	387 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	TAF1	P46677	1066 aa		18.47	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	PEX1	P24004	1043 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	VBA3	P25594	458 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	PXL1	P36166	706 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	VBA5	P36172	582 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	TGL3	P40308	642 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	VPS70	P47161	811 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	TAD1	P53065	400 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	HRT3	Q12347	344 aa		18.46	■□□□□ 0.55
SRX1	YKL086W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	GPM2	Q12008	311 aa		18.45	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	ATG9	Q12142	997 aa		18.45	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	CLC1	P17891	233 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	TKL2	P33315	681 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	18.44	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	JNM1	P36224	373 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	DSE1	P40077	573 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	IES1	P43579	692 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	PRM6	Q04705	352 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	HMI1	Q12039	706 aa		18.44	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
SRX1	YKL086W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.7 ms