RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	XRS2	P33301	854 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	HSL7	P38274	827 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	YHR131C	P38835	850 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	LCB2	P40970	561 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	VTC4	P47075	721 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	GAD1	Q04792	585 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	RSC3	Q06639	885 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	OMS1	Q06668	471 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	GUP2	Q08929	609 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	PHM7	Q12252	991 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	FRE6	Q12473	712 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	ATP12	P22135	325 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	YCL049C	P25577	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	HOG1	P32485	435 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	SLA1	P32790	1244 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	CIR1	P42940	261 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	LAM5	P43560	674 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	CBK1	P53894	756 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	RMT2	Q03305	412 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	COG8	Q04632	607 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	PMT7	Q06644	662 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
IKS1	YJL057C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	SGF29	P25554	259 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	YER010C	P40011	234 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	KHA1	P40309	873 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	LYS14	P40971	790 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	MLH2	Q07980	695 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	NUR1	Q12066	484 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	DCS2	Q12123	353 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	ARG3	P05150	338 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	ADP1	P25371	1049 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	PUP2	P32379	260 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	AFR1	P33304	620 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	UIP5	P36137	443 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	APM3	P38153	483 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	IFA38	P38286	347 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	RIM11	P38615	370 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	RTS1	P38903	757 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	NAS2	P40555	220 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	YNR068C	P53754	272 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	PCL8	Q08966	492 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	HFI1	Q12060	488 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	WTM2	Q12206	467 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	ISA2	Q12425	185 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	RTN2	Q12443	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	MER1	P16523	270 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	MLF3	P32047	452 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	MIC60	P36112	540 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	FAT1	P38225	669 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	TDA3	P38758	523 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	SGF73	P53165	657 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	VPS9	P54787	451 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	YML119W	Q03208	357 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	TAP42	Q04372	366 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	APL4	Q12028	832 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	SMI1	P32566	505 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	FBP26	P32604	452 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	OAF3	P36023	863 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	CTM1	P38818	585 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	AIM46	P38885	310 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IKS1	YJL057C	BUD16	P39988	312 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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