RNA–Protein interactions for RNA: YGR006W

PRP18, Transcript of Splicing factor and component of snRNP U5, yeast

Gene PRP18, Length 756 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRP18	YGR006W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
PRP18	YGR006W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	GPR1	Q12361	961 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	MRC1	P25588	1096 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	DCG1	P32460	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	CTF13	P35203	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	SIC1	P38634	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	RPP1	P38786	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	BFA1	P47113	574 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	YGR153W	P48238	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	TOM20	P35180	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	ECM1	P39715	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	NRG1	Q03125	231 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	ASM4	Q05166	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	MNN4	P36044	1178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	DID4	P36108	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	YKR075C	P36155	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	APT2	P36973	181 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	TMA17	Q12513	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRP18	YGR006W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	APN2	P38207	520 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	ARP4	P80428	489 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	TRE2	Q08693	809 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	DCS2	Q12123	353 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	CTS1	P29029	562 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	ERG5	P54781	538 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	ECM9	Q02202	377 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	MCM21	Q06675	368 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	LAS17	Q12446	633 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	MET3	P08536	511 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	HCM1	P25364	564 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	EUG1	P32474	517 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	GID8	P40208	455 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	FKH2	P41813	862 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	AMA1	P50082	593 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	REC102	Q02721	264 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	DLT1	Q04216	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	ESC8	Q08119	714 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	YBR071W	P38243	211 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	YHM2	Q04013	314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	IOC4	Q04213	475 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	GAD1	Q04792	585 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	AIM39	Q08223	395 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	TGL5	Q12043	749 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	APM4	Q99186	491 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	AEP2	P22136	580 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	YKL222C	P35995	705 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	YHR202W	P38887	602 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	HXT7	P39004	570 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	BEM4	P39011	633 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	YIR042C	P40586	236 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	PHO23	P50947	330 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	MRPS35	P53292	345 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	FOL1	P53848	824 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	HFI1	Q12060	488 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	NTO1	Q12311	748 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	RMP1	Q12530	201 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	SWI6	P09959	803 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	SEC65	P29478	273 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	OAF3	P36023	863 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	KTR4	P38131	464 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	YHR112C	P38716	378 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	TAF1	P46677	1066 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	YJR120W	P47157	116 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRP18	YGR006W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PRP18	YGR006W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65

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