RNA–Protein interactions for RNA: YGL063W

PUS2, Transcript of Mitochondrial tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS2, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS2	YGL063W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PUS2	YGL063W	FMP25	Q08023	583 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PUS2	YGL063W	SLX4	Q12098	748 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PUS2	YGL063W	HRT3	Q12347	344 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PUS2	YGL063W	SCJ1	P25303	377 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	PSO2	P30620	661 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	SIF2	P38262	535 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	ARP1	P38696	384 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	FIG4	P42837	879 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	YGR237C	P50089	785 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	NSE5	Q03718	556 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	COG4	Q06096	861 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	RGA2	Q06407	1009 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	TAF10	Q12030	206 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	GPM2	Q12008	311 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	KEX1	P09620	729 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	CDC42	P19073	191 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	GAC1	P28006	793 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	FAP1	P53971	965 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	AFT2	Q08957	416 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	GAL10	P04397	699 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	HIS5	P07172	385 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	RRT12	P25381	491 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	MET4	P32389	672 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	FRE1	P32791	686 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	TKL2	P33315	681 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	SFB3	P38810	929 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	CTM1	P38818	585 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	CIR1	P42940	261 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	ISF1	P32488	338 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	HER2	Q03557	464 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	APC11	Q12157	165 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	SGF29	P25554	259 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	CDC27	P38042	758 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	YBR056W	P38081	501 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	DSE1	P40077	573 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	YNL011C	P53980	444 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	PRM6	Q04705	352 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	YDL206W	Q12424	762 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PUS2	YGL063W	CPR7	P47103	393 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	COS5	P47187	383 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	SFB2	P53953	876 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	MUB1	Q03162	620 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	WAR1	Q03631	944 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	DUG2	P38149	878 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	GEM1	P39722	662 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	YJR054W	P47114	497 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	PPM1	Q04081	328 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	NSE1	Q07913	336 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	YPQ1	Q12010	308 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	AIM44	Q99299	758 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	RAD16	P31244	790 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	CBF2	P32504	956 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	YKR051W	P36142	418 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	KIC1	P38692	1080 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	HXT5	P38695	592 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	ZAP1	P47043	880 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	HAP5	Q02516	242 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	BSP1	Q06604	576 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	YAP7	Q08182	245 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	TRS33	Q99394	268 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	STE11	P23561	717 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	BCH2	P36122	765 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	RAD55	P38953	406 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.04	□□□□□ -0.32	not detected
PUS2	YGL063W	YHM2	Q04013	314 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	YLR297W	Q05899	129 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	NDJ1	Q12366	352 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
PUS2	YGL063W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32

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