RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RNQ1	YCL028W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	FMP30	Q02883	468 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	LDB19	Q12502	818 aa		11.94	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	YKL050C	P35736	922 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	YHR054C	P38780	354 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	YGR021W	P53212	290 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	VAC14	Q06708	880 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	ECM3	Q99252	613 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		11.93	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	YHL026C	P38740	315 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	TCD1	P38756	429 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	SML1	Q04964	104 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	YLR455W	Q06188	304 aa		11.92	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	GAL10	P04397	699 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	HXT1	P32465	570 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	CSE2	P33308	149 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	DYS1	P38791	387 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	NDC80	P40460	691 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	ALT1	P52893	592 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	CDD1	Q06549	142 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	SIL1	Q08199	421 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	YOR022C	Q12204	715 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	MCM16	Q12262	181 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	CKI1	P20485	582 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	SCJ1	P25303	377 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	RRN6	P32786	894 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	BRL1	P38770	471 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	YTA12	P40341	825 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	YFL040W	P43562	540 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	STB4	P50104	949 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RNQ1	YCL028W	MOT1	P32333	1867 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	TBS1	P38114	1094 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	PSY2	P40164	858 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	ESL1	P40456	1118 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	SPO74	P45819	413 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	YGR130C	P53278	816 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	JJJ1	P53863	590 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	BOP3	P53958	396 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	VPS60	Q03390	229 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	YMR018W	Q04364	514 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	PIB1	Q06651	286 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	CTF3	Q12748	733 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	ERG11	P10614	530 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	GYP6	P32806	458 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	HEL1	P36113	551 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	PHO86	P46956	311 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	YGR035C	P53222	116 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	NGL3	Q03210	505 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	YPR027C	Q12079	277 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	YER152C	P10356	443 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	BLI1	P35727	113 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	GEM1	P39722	662 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	FIR1	P40020	876 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	KAP114	P53067	1004 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	BTN2	P53286	410 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.87	□□□□□ -0.51	not detected
RNQ1	YCL028W	EEB1	Q02891	456 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	RIF1	P29539	1916 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	MRM1	P25270	412 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	AGP2	P38090	596 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	ZAP1	P47043	880 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	YGR111W	P53265	400 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	ESC8	Q08119	714 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	CHS1	P08004	1131 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	PET111	P08468	800 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	VPS3	P23643	1011 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	POA1	P38218	177 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	YDR222W	Q04925	415 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	REC8	Q12188	680 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	SLX1	P38324	304 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RNQ1	YCL028W	TDA3	P38758	523 aa		11.84	□□□□□ -0.51

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