RNA–Protein interactions for RNA: YBL078C

ATG8, Transcript of Component of autophagosomes and Cvt vesicles, yeast

Gene ATG8, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG8	YBL078C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	MSS18	P08593	268 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	REC104	P33323	182 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	MNN4	P36044	1178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	JNM1	P36224	373 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	YAR028W	P39548	234 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	ACA1	P39970	489 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	MXR1	P40029	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	NPY1	P53164	384 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	ECM9	Q02202	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	GUP2	Q08929	609 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	YVC1	Q12324	675 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	DOP1	Q03921	1698 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	SSM4	P40318	1319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	BNR1	P40450	1375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	TOA1	P32773	286 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	SCT1	P32784	759 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	ELM1	P32801	640 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	EMC3	P36039	253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	QRI7	P43122	407 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	VPS30	Q02948	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	ATP25	Q03153	612 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	COG8	Q04632	607 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	TRE1	Q08919	783 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG8	YBL078C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	ENA1	P13587	1091 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	PHO81	P17442	1178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	ADP1	P25371	1049 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	CHS3	P29465	1165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	BEM3	P32873	1128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	LRG1	P35688	1017 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	BLI1	P35727	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	DID4	P36108	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	TDA3	P38758	523 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	IML2	P47031	731 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	BNA1	P47096	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	TAD1	P53065	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	DAM1	P53267	343 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	GTR1	Q00582	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	ENV7	Q12003	364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	RTP1	Q12751	981 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	DFG16	Q99234	619 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	YKU70	P32807	602 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	YKL151C	P36059	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	HSE1	P38753	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	PEX7	P39108	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	ECL1	P48235	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	SLD3	P53135	668 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	SSY1	Q03770	852 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	TPP1	Q03796	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	HIM1	Q06674	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	LAP2	Q10740	671 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	SPO21	Q12411	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	MIH1	P23748	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	SEG2	P34250	1132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	HXT7	P39004	570 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	GPB2	P39717	880 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	RET2	P43621	546 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	SKY1	Q03656	742 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	YHM2	Q04013	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	NHX1	Q04121	633 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	PEX15	Q08215	383 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	KIP1	P28742	1111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	PRO1	P32264	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	EMP65	P40085	556 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	ESL1	P40456	1118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	TMA108	P40462	946 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	MEP3	P53390	489 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	ORC3	P54790	616 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG8	YBL078C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.1 ms