RNA–Protein interactions for RNA: Q0142

Q0142, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0142, Length 177 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0142	Q0142	SCT1	P32784	759 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	ATG4	P53867	494 aa		5.07	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	TAD1	P53065	400 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
Q0142	Q0142	YML020W	Q03722	664 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	THI21	Q08975	551 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	PET10	P36139	283 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	MUP3	P38734	546 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.04	□□□□□ -1.6	not detected
Q0142	Q0142	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	NUP1	P20676	1076 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	FMO1	P38866	432 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	ALR2	P43553	858 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	PFD1	P46988	109 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	MTL1	P53214	551 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	YBR184W	P38299	523 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	FHN1	P53279	174 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Q0142	Q0142	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	PHO11	P35842	467 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	PHO12	P38693	467 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	ECM1	P39715	212 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	NUP60	P39705	539 aa		5	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	YPL068C	Q02749	293 aa		5	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	FMP30	Q02883	468 aa		5	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	MLH3	Q12083	715 aa		5	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	LYS9	P38999	446 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	YBP2	P53169	641 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	EMC3	P36039	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	FUB1	P25659	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	GMH1	P36125	273 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	UBX5	Q06682	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	FMP25	Q08023	583 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Q0142	Q0142	APN1	P22936	367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	ZIP2	P53061	704 aa		4.96	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	USV1	Q12132	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	YHR112C	P38716	378 aa		4.95	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	SHR5	P41912	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.95	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	STE12	P13574	688 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	GYP8	P43570	497 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	REH1	Q06709	432 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	ZRT2	Q12436	422 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	KCC4	P25389	1037 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	EAF1	Q06337	982 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	SET3	P36124	751 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	VAC8	P39968	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	STP1	Q00947	519 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	YDR514C	Q04408	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Q0142	Q0142	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	TAX4	P47030	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	SPC98	P53540	846 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	YMC1	P32331	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	ERP6	P53198	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	DIF1	O13577	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	YMC2	P38087	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	ARE1	P25628	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	APT2	P36973	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	SPO75	Q07798	868 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	MBR1	P23493	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	HFD1	Q04458	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	SVF1	Q05515	481 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	MCM21	Q06675	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	YGR151C	P53287	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	MET7	Q08645	548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Q0142	Q0142	MIT1	P40002	666 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 54.1 ms